تجزیه و تحلیل ساختار کامل ناحیه دی لوپ میتوکندریایی به همراه موتیف‌های تنظیمی در چهار گونه ماهیان خاویاری دریای خزر

Abstract

در این پژوهش قطعه کامل دی لوپ به همراه موتیف‌های تنظیمی آن در چهار گونه از ماهیان خاویاری دریای خزراز جنس <em>Acipenser</em> (چالباش <em>A.Gueldenstadtii</em>، قره برون <em>A.persicus</em>، شیپ <em>A.nudiventris</em>، اوزون برون <em>A.stellatus</em>) مورد بررسی قرار گرفت. استخراج DNAبا استفاده از روش استات آمونیوم و واکنش PCR توسط یک جفت آغازگر اختصاصی جهت تکثیر ناحیه کامل دی لوپ انجام گرفت. توالی‌یابی با استفاده از روش سنگر انجام شد. توالی تکراری مینی ستلایت در ناحیه بالادست دی لوپ و بعد از توالی کدکننده تی آر ان آ پرولین در همه گونه‌ها به جز شیپ مشاهده شد. نتایج نشان داد که واحدهای تکراری مرکزی 83-82 جفت بازی با 2/3 تکرار در چالباش و قره‌برون و 4/2 تکرار در اوزون‌برون سبب تنوع طول در این ناحیه شده است. علاوه بر این توالی تکراری مرکزی، دو توالی تکراری دیگر با اندازه 39 و 43 جفت باز نیز در این بخش مشاهده شد که این توالی ها نیز با 2/3 تکرار در این ناحیه وجود داشتند. طول ناحیه کنترلی در گونه‌های چالباش، قره‌برون، اوزون‌برون و شیپ به ترتیب برابر با 921، 870، 826 و 839 جفت باز بود. بررسی ساختار کلی ناحیه دی لوپ نشان داد که ناحیه کنترلی ماهیان خاویاری شامل همولوگ‌هایی از بلوک‌های توالی محافظت شده CSB می‌باشد که واحد های تکراری مینی ستلایت در بالادست این بلوک‌ها واقع شده‌اند. حضور توالی های تکراری مینی ستلایت در ناحیه کنترلی دی لوپ اهمیت این نشانگرها را در برنامه های حفظ منابع ژنتیکی و غربالگری ماهیان خاویاری نشان می دهد.