شبیه‌سازی دینامیک مولکولی اضافه شدن رشته‌ی PAS به داروی پپتیدی G-CSF و پیشنهاد توالی جدید برای رشته‌ی PAS به منظور بهبود عمل‌کرد داروی مورد نظر

Abstract

در مطالعات اخیر، PASylation به عنوان یک روش موثر به منظور افزایش نیمه‌عمر داروهای پروتئینی و جایگزینی مناسب برای PEGylation مطرح شده است. در این روش، یک رشته‌ی به مراتب زیست‌سازگارتر و متشکل از پلیمرهای طبیعی، شامل پرولین، آلانین و سرین، که به اختصار به آن رشته‌ی PAS گفته می­شود، برای بهبود مشخصه­های دارو مورد استفاده قرار می­گیرد. در این مقاله، برخی از مشخصه­های داروی G-CSF، نظیر میانگین توانی فاصله‌ی اتمی (RMSD)، حجم هیدرودینامیکی، انرژی کل و میزان آب­دوستی پروتئین مورد بررسی قرار گرفته است. در این راستا، خواص مختلف داروی پروتئینی متصل به رشته‌ی PAS برای سه طول مختلف رشته‌ی مورد نظر (طول­های 210، 420 و 630) مورد بحث و بررسی قرار گرفته است. نتایج به دست آمده بیان‌گر این نکته است که با اتصال رشته‌ی PAS به داروی پروتئینی، حجم هیدرودینامیکی آن افزایش یافته و به واسطه‌ی آن نیمه‌عمر دارو نیز افزایش می­یابد. در نهایت، با در نظر داشتن نتایج به دست آمده در این قسمت، یک توالی اصلاح‌شده برای رشته‌ی PAS مورد نظر پیشنهاد شده است.