مقایسه تنوع ژنتیکی ماهی شیپ ( Acipenser nudiventris ) در سواحل جنوبی دریای خزر و رودخانه اورال بااستفاده از روش PCR-RFLP

Abstract

<br /> <br /> <br /> <br /> تنوع ژنتیکی ماهی شیپ (Acipenser nudiventris) دریای خزر با استفاده از ژنهای دهیدروژناز 5 و 6 (NADH5.6) و روش PCR-RFLP مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور 80 عدد ماهی شیپ از سواحل جنوبی دریای خزر و رودخانه اورال در قزاقستان جمع آوری گردید. ژن ND5.6 ژنوم میتوکندریایی بوسیله PCR تکثیر و سپس با 39 آنزیم برشگر اندونوکلئاز هضم گردید. از 39 آنزیم پنج آنزیم برشگرHaeIII، DraI، MboI TasI، Cfr13I تنوع چند شکلی از خود نشان دادند. در مجموع بین نمونه های بررسی شده 10 ترکیب هاپلوتیپی بدست آمد که از بین هاپلوتیپ های شناخته شده هاپلوتیپ AAAAA بیشترین فراوانی (75.5 درصد) را داشت. دو هاپلوتیپ BABAA، BBAAA حداقل فراوانی (1.2 درصد) را نشان دادند و هاپلوتیپ AAAAB با فراوانی (5 درصد) مختص نمونه های رودخانه اورال بوده است. میانگین تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی بترتیب 0.5816 و 0.007 درصد بدست آمد. میزان تنوع نوکلئوتیدی بدست آمده در این بررسی نسبت به سایر تاسماهیان دریای خزر (تاسماهی ایرانی، روسی و ازون برون) بسیار پایین تر بوده است که این امر می تواند ناشی از کوچک بودن اندازه جمعیتهای این گونه باشد. آنالیز آماری و شبیه سازی Monte-Carlo با 1000 بار تکرار نشان داد که توزیع هاپلوتیپ ها در بین مناطق مختلف نمونه برداری در جنوب دریای خزر اختلاف معنی داری ندارد (P=0.74، X2=35.48) اما بین جمعیت شیپ رودخانه اورال و حوضه جنوبی دریای خزر اختلاف معنی داری وجود دارد (P=0.00، 137.35=X2). نتایج این بررسی نشان می دهد که جمعیت ماهی شیپ رودخانه اورال از جمعیت ماهی شیپ در سواحل جنوبی دریای خزر متفاوت است و آنزیم Cfr13I یک مارکر مولکولی جهت تمایز این دو جمعیت می باشد.