شناسایی و بررسی خصوصیات چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین–8 در گاوهای بومی و هلشتاین ایران

Abstract

زمینه مطالعه: اینترلوکین–8، سیتوکین پیش التهابی، پروتیین کوچکی است که نقش آن جذب و فعال کردن نوتروفیل‌ها در مراحل اولیه دفاع میزبان در مقابل هجوم باکتری‌ها است. چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین–8 می‌تواند با تأثیر بر فرآیند رونویسی این ژن، نقش و فعالیت آن را تحت تأثیر قرار دهد. هدف: شناسایی و بررسی چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر این ژن در گاوهای بومی و هلشتاین بوده است. روش کار: بخشی از ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین–8 توسط تکنیک تفاوت فرم فضایی رشته‌های منفرد ‌(SSCP)‌ در گاوهای دو نژاد تعیین ژنوتیپ شد. سپس هر الگوی مشاهده شده تعیین توالی شد و همترازی بین توالی‌ها جهت شناسایی چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی صـورت گـرفـت. همچنیـن، تجـزیـه و تحلیل بیوانفورماتیکی جهت بررسی ارتباط چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی برراندمان اتصال فاکتورهای رونویسی در ناحیه تکثیر شده صورت گرفت. نتایج: در این مطالعه، در کل نمونه‌های بررسی شده تعداد 4 الگوی ‌(SSCPs)‌ مجزا مشاهده شد که با تعیین توالی نوکلئوتیدی آنها تعداد 2 چند شکلی تک نوکلئوتیدی در جایگاه‌های 126– و 180– قبل از شروع رونویسی آشکار شد که چندشکلی تک نوکلئوتیدی جایگاه 126– تنها درگاوهای بومی مشاهد شد. بررسی بیوانفورماتیکی چند شکلی‌های شناسایی شده روی جایگاه فاکتورهای رونویسی نشان داد که جایگزینی نوکلئوتیدها در جایگاه‌های 126– و 180– به ترتیب منجر به ایجاد جایگاه اتصال برای فاکتورهای رونویسی 2Ik-‌ و ‌1Oct- شد. نتیجه گیری نهایی: امکان نقش کاربردی چندشکلی‌های شناسایی شده در فعالیت این ژن باید با استفاده از آزمون بیان ژن به اثبات برسد. مطالعات بیشتری جهت ارزیابی چند شکلی‌های شناسایی شده بر روی صفات مقاومت به بیماری در گاو مورد نیاز می‌باشد. <br />