شناسایی مولکولی و فیلوژنی گونه Gammarus komareki (Gammaridae) از رودخانه جاجرود با روش بارکدگذاری DNA

Abstract

گاماروس­ها از انواع سخت­پوستان ناجورپا متعلق به خانواده Gammaridae بوده که نقش و اهمیت زیادی در زنجیره غذائی، پالایش محیط از مواد آلی و حساسیت بالایی نسبت به آلودگی‌های محیطی دارند. بنابراین شناسایی آن­ها از اهمیت زیادی برخوردار است. از آن­جایی­که شناسایی جنس گاماروس به­دلیل ویژگی­های ریخت­شناسی شبیه به هم بسیار مشکل می­باشد؛ هدف مطالعه حاضر شناسایی دقیق مولکولی و بررسی روابط فیلوژنی گونه <em>Gammarus</em> <em>komareki</em>از رودخانه جاجرود در شرق استان تهران در مقایسه با سایر نقاط ایران و جهان بود. بدین منظور نمونه­برداری از گونه <em>G. komareki </em>رودخانه جاجرود به صورت فصلی از مهرماه 1392 تا تیرماه 1393 صورت پذیرفت. جمع­آوری نمونه­ها توسط تور دستی کوچک انجام شد. به منظور مطالعات مولکولی مقداری بافت از هر نمونه با اسکالپل جدا و در الکل اتیلیک 95 درجه تثبیت گردید. سپس DNA نمونه­ها با استفاده از روش CTAB استخراج و قطعه ژنی زیر واحد یک سیتوکروم اکسیداز میتوکندری (COI) تکثیر و توالی­یابی شد. پس از تکثیر قطعه ژن و توالی­یابی آن، درخت­های تبارشناسی Neighbor Joining وMaximum Likelihood با استفاده از نرم­افزارهای MEGA7 ترسیم گردیدند. نتایج مطالعه حاضر نشان داد با این­که نمونه­های موردنظر از نظر ریخت­شناسی متعلق به گونه <em>Gammarus</em> <em>komareki</em> می­باشند که از سایر مناطق ایران گزارش شده است؛ با این­حال از نظر بررسی­های ژنتیکی در کلادهای کاملاً جداگانه قرار گرفتند. بنابراین احتمال می­رود متعلق به گونه­های جداگانه باشند که اثبات این امر نیازمند بررسی­های دقیق­تر با سایر نشانگرهای ژنتیکی می­باشد.