بررسی گسترده ژنومی خانواده ژن‌های پاسخ‌گو به هورمون اکسین (ARF) در لوبیا

Abstract

اکسین نقش مهمی در تنظیم مراحل مختلف رشد و نمو گیاهان دارد. مطالعات نشان‌ داده است که اکسین این فرآیندها را با استفاده از ژن‌های پاسخ‌گو به اکسین (ARF) تنظیم می‌کند. با توجه به نوع دومین میانی، پروتئین ARF به عنوان یک فاکتور رونویسی با اتصال به ژن‌های هدف باعث سرکوب و یا تحریک بیان این ژن‌ها می‌شود. ژن‌های ARF در چند گونه مختلف گیاهی با استفاده از روش‌های مولکولی مورد مطالعه قرار گرفته‌اند، با این حال برای درک بهتر مکانیسم این پروتئین‌ها نیاز به مطالعات بیشتری در گیاهان است. در این مطالعه با استفاده از روش‌های محاسباتی 27 ژن ARF شناسایی شد که در قسمت‌های مختلف کروموزوم‌های لوبیا پراکنده هستند. بررسی‌ درخت فیلوژنتیکی نشان داد این توالی‌ها در چهار گروه مجزا قرار دارند بدون اینکه در بین این توالی‌ها مضاعف‌شدگی مشاهده شود. بیان ژن‌های ARF باتوجه به نوع ژن و بر اساس نوع بافت به ترتیب به پنج و دو گروه تقسیم شد. ژن‌های ARF در بافت‌های برگ، سه برگچه‌های جوان، ساقه، غلاف‌های رسیده و غلاف‌های جوان در مقایسه با سایر بافت‌های دیگر بیان بیشتری داشتند. از کل توالی‌های ARF مورد بررسی، تعداد 9 و 17 توالی به ترتیب به عنوان محرک و سرکوب‌کننده بیان ژن شناسایی شدند.