مقایسه مولکولی ناحیه ΄5 ژنوم جدایه گلستان ویروس موزاییک کوتولگی ذرت (MDMV) با دیگر پوتی¬ویروسهای غلات

Abstract

ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus, MDMV)یکی از مهم¬ترین و گسترده¬ترین ویروس¬های ذرت در دنیا می¬باشد. تحقیق حاضر به منظور مقایسه خصوصیات مولکولی و آنالیز ترادف نوکلئوتیدی نواحی کد¬کننده پروتئین¬های موجود در ناحیه ΄5 ژنوم ویروس موزاییک کوتولگی ذرت و مقایسه آن با سایر جدایه¬های این ویروس و نیز سایر پوتی¬ویروس¬های غلات انجام گردید. بدین منظور گیاهان ذرت با علائم موزاییک و کوتولگی از استان گلستان جمع آوری شد. پس از تعیین آلودگی در آزمون الایزای غیر مستقیم با آنتی سرم اختصاصی MDMV یک نمونه آلوده جهت استخراج RNAی کل انتخاب شد. جهت تکثیر ناحیه¬ی ΄5 ژنوم ویروس از 5 جفت آغازگر اختصاصی استفاده شد که 5 قطعه همپوشان شامل UTR-΄5، P1، HC-Pro، P3و 6K1 به اندازه کل 3460 جفت باز بدست آمد. آنالیز¬های مقایسه¬ای ترادف نوکلئوتیدی این ناحیه از ژنوم MDMV نشان داد که جدایه ایران (گلستان) به ترتیب دارای شباهت 7/95 و 3/92 درصد در سطح آمینواسیدی و 5/90 و 1/85 درصد در سطح نوکلئوتیدی با جدایه¬های بلغارستان و اسپانیا است و در مقایسه با سایر ویروس¬های آلوده کننده غلات هم¬گروه با MDMV بیشترین شباهت با ویروس موزاییک سورگوم از تگزاس و ویروس موزاییک نیشکر از چین به ترتیب با 9/72 و 3/72 درصد بدست آمد.