تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه‌های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته‌دار در استان‌های خراسان رضوی و شمالی

Abstract

باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss)عامل یکی از بیماری‌های شایع در باغ‌های درختان میوه هسته‌دار می‌باشد. به منظور شناسایی جدایه‌های عامل بیماری، طی سال‌های 1391-1390، 23 جدایه به‌دست آمده از باغ‌های درختان میوه هسته‌دار واقع در مناطق مختلف استان‌های خراسان رضوی و شمالی از نظر فنوتیپی (فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی) و بیماری‌زایی مورد بررسی قرار گرفتند. جدایه‌ها از نظر ویژگی‌های فنوتیپی اختلافات جزئی نشان دادند. همه جدایه‌ها روی هلو و بادام دارای قدرت بیماری‌زایی بالایی بودند و از این نظر مشابه به نظر رسیدند. صحت تشخیص جدایه‌ها در سطح گونه توسط واکنش زنجیره‌ای پلیمراز و با استفاده از آغازگر‌های D21/D22 اختصاصی گونه مورد تایید قرار گرفت. تنوع ژنتیکی جدایه‌ها به دو روشrepetitive element palindromic PCR (rep-PCR) و با استفاده از آغازگر‌های BOXA1R، ERIC1R و ERIC2 و روش Insertion Sequence PCR (IS-PCR) و با استفاده از آغازگر IS50 مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز خوشه‌ای نتایج به دست آمده نشان داد که در BOX-PCR با آغازگر BOXA1Rدر سطح تشابه 75 درصد، جدایه‌ها به 7 گروه؛ در ERIC-PCR با آغازگر ERIC1R در سطح تشابه 65 درصد، جدایه‌ها به 7 گروه و با آغازگر ERIC2 در سطح تشابه 56 درصد، جدایه‌ها به 8 گروه؛ در IS-PCR با آغازگر‌IS50 در سطح تشابه 52 درصد، جدایه‌ها به 11 گروه و در نهایت با ترکیب هر چهار آغازگر‌ در سطح تشابه 54 درصد جدایه‌ها به 7 گروه قابل تفکیک هستند. نتایج بیانگر تنوع ژنتیکی بالا درون جدایه‌های عامل بیماری شانکر باکتریایی درختان میوه هسته‌دار در استان‌های مورد مطالعه است.