آنالیز فیلوژنتیکی چهار جدایه های ایرانی ویروس کوتولگی زرد کدوییان بر اساس انتهای 3 آر. ان. ای شماره 1 (مقاله‌ی کوتاه انگلیسی)

Abstract

به منظور آنالیز فیلوژنتیکی جدایه های ایرانی ویروس کوتولگی زرد کدوییان (<em>Cucurbit yellow stunting disorder virus</em>, CYSDV) ناحیه انتهای ¢3 RNA₁ (به طول 560 نوکلئوتید) از چهار جدایه ویروس کوتولگی زرد کدوییان جمع آوری شده از استان های بوشهر، کرمان (جیرفت)، خوزستان(دزفول) و تهران با واکنش زنجیره ای پلی مراز و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر شد. ترادف نوکلئوتیدی ناحیه مذکورتعیین و با توالی‌های موجود در Gen Bank مقایسه شد. نتایج نشان دهنده تشابه ترادف نوکلئوتیدی بالا (98-99%) بین جدایه‌های CYSDV بود و تشابه ترادف بین جدایه های ایرانی 99 درصد بود. درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده به روش نزدیک‌ترین همسایه با استفاده از ترادف نوکلئوتیدی ناحیه تکثیر شده نشان داد که تمامی جدایه های CYSDV در یک گروه قرار گرفته و جدایه های بوشهر، خوزستان و تهران در زیر گروه مجزا نسبت به سایر جدایه های مورد بررسی قرار گرفتند.