بررسی تنوع فنوتیپی و ژنوتیپی جدایه‌های Agrobacterium از میزبان‌های مختلف در استان‌های فارس و کهگیلویه و بویراحمد

Abstract

در سال‌های 1387 و 1388 از باغ‌های مو، گلخانه‌های پرورش گل رز و هم‌چنین مزارع چغندرقند در استان‌های فارس و کهگیلویه و بویراحمد بازدید و از گیاهان دارای علایم گال طوقه و ریشه و خاک اطراف آنها نمونه‌برداری و به آزمایشگاه منتقل شد. جداسازی عامل بیماری روی محیط‌های <em>NA</em>، <em>DIM agar</em>، <em>1A</em> و <em>RS</em> انجام گرفت. پس از خالص‌سازی جدایه‌ها، با انجام آزمون‌های استاندارد باکتری‌شناسیجدایه‌ها به‌عنوان <em>A. vitis</em> و<em>biovar 1</em><em> A. tumefaciens</em> تشخیص داده شدند. آزمون بیماری‌زایی روی گیاهان کالانکوئه، گوجه‌فرنگی و آفتابگردان انجام شد و اکثرجدایه‌ها توانستند در این گیاهان تولید گال کنند. برای تشخیص بیماری‌زایی جدایه‌ها نیز از آغازگرهای اختصاصی <em>A/C´</em>و <em> </em><em>VCF/VCR</em> استفاده شدکه به‌ترتیب تمام جدایه‌ها باندهای 224 و 730 جفت بازی را تکثیر کردند. در بررسی آزمون <em>rep-PCR</em> با استفاده از آغازگرهای <em>BOX</em> و <em>ERIC</em> تنوع زیادی در بین جدایه‌ها مشاهده گردید. جدایه‌های به‌دست آمده از مناطق مختلف استان‌های فارس و کهگیلویه و بویراحمد به دو گروه کلی قابل تقسیم بودند. گروه یک نیز به دو زیر گروه تقسیم شد، که یک زیر گروه شامل جدایه‌های <em>A.vitis</em> (جدا شده از درختان مو) و زیر گروه دیگر شامل جدایه‌های <em>A. tumefaciens</em> (جدا شده از رز و چغندرقند) بود. گروه دوم نیز تعداد کمی از جدایه‌های <em>A. tumefaciens</em> (جدا شده از رز و چغندرقند) را شامل شد. حداکثر شباهت در آزمون <em>rep-PCR</em> در داخل گونه <em>A. vitis</em> با حدود 88 درصد به‌دست آمد. گروه‌بندی براساس خصوصیات ژنوتیپی تا حدودی با گروه‌بندی براساس خصوصیات فنوتیپی مطابقت داشته و آزمون‌های فنوتیپی و <em>rep-PCR</em> به خوبی توانستند گونه‌های <em>A.vitis</em> و <em>A. tumefaciens</em> را از هم تفکیک نمایند.