بررسی مولکولی و فیلوژنتیکی جدایه‌های جنس Rhizopus بر اساس منطقه ITS و مناطق D1-D2 از DNA ریبوزومی *

Abstract

<strong>سی و هفت جدایه از جنس </strong><strong><em>Rhizopus</em></strong><strong> به دست آمده از میزبان‌های مختلف در استان‌های تهران، آذربایجان غربی، یزد و کردستان جهت مطالعات تاکسونومیکی مورد بررسی قرار گرفتند. منطقه </strong><strong>ITS</strong><strong> شامل ژن </strong><strong>5.8S</strong><strong> و مناطق </strong><strong>D1-D2</strong><strong> مربوط به </strong><strong>DNA</strong><strong> ریبوزومی با استفاده از جفت آغازگرهای </strong><strong>ITS1/NL4</strong><strong> تکثیر شدند. محصولات تکثیر شده توسط </strong><strong>PCR</strong><strong> با استفاده از آنزیم‌های برشی </strong><strong><em>Hae</em></strong><strong>III</strong><strong>، </strong><strong><em>Rsa</em></strong><strong>I</strong><strong>، </strong><strong><em>Hinf</em></strong><strong>I</strong><strong> و </strong><strong><em>Msp</em></strong><strong>I</strong><strong> مورد هضم آنزیمی قرار گرفتند و هفت جدایه نماینده، انتخاب شده و توالی‌یابی شدند. توالی‌های به</strong><strong>دست</strong><strong>آمده</strong><strong>با</strong><strong>23</strong><strong>توالی</strong><strong>از بانک ژن مقایسه</strong><strong>شدند. براساس آنالیز</strong><strong>فیلوژنتیک</strong><strong>و</strong><strong>محاسبه</strong><strong>فاصله ژنتیکی جدایه‌های </strong><strong><em>Rhizopus</em></strong><strong> در سه گروه قرار گرفتند. بر اساس نتایج به دست آمده، سه گونه شناسایی شد: </strong><strong><em> R. lyococcus</em></strong><strong>، </strong><strong><em>R. stolonifer </em></strong><strong>var.<em> stolonifer</em></strong><strong>و </strong><strong><em>R. oryzae</em></strong><strong><em>.</em></strong><strong> گونه </strong><strong><em>R. lyococcus</em></strong><strong>برای نخستین بار از ایران گزارش می‌شود. هر سه گونه شناسایی شده برای اولین بار از میزبان‌های هلو، شلیل، زردآلو، توت‌فرنگی، طالبی، خرمالو، آفتاب‌گردان و گوجه‌فرنگی از ایرانجداسازی شده‌اند و گونه </strong><strong><em>R. stolonifer</em></strong><strong> var<em>. stolonifer</em></strong><strong> برای اولین بار از روی شلیل از دنیا گزارش می‌شود. در این تحقیق نشان داده شد که مناطق </strong><strong>D2</strong><strong>-</strong><strong>D1</strong><strong> از بخش </strong><strong>LSU</strong><strong> در </strong><strong>DNA</strong><strong> ریبوزومی نسبت به منطقه </strong><strong>ITS</strong><strong> در فیلوژنی این جنس مناسب‌تر است.</strong>