جداسازی و آنالیز فیلوژنتیکی یک جدایه ویروس پیچیدگی برگ شلغم از گیاه تاتوره

Abstract

ویروس پیچیدگی برگ شلغم (<em>Turnip curly top virus</em>,TCTV) به­ عنوان ویروس تیپ جنس <em>Turncurtovirus</em> از خانواده <em>Geminiviridae</em> چند سال قبل از ایران گزارش گردید. این ویروس دارای دامنه میزبانی وسیعی در میان سبزیجات و علف‌های هرز است. در این پژوهش، آلودگی گیاه تاتوره (<em>Datura stramonium</em> L.) با علائم زردی عمومی، پیچیدگی شدید و فنجانی شدن برگ‌ها با استفاده از آزمون پی سی آر، به TCTV اثبات گردید. سپس طول کامل ژنوم ویروس با تلفیق پی سی آر و روش تکثیر دایره غلتان (rolling circle amplification, RCA) و استفاده از یک جفت آغازگر همپوشان تکثیر و بعد از همسانه‌سازی، در ناقل pJET1.2 تعیین ترادف گردید و ترادف بدست آمده به لحاظ فیلوژنتیکی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج بدست آمده بیانگر آن است که جدایه تاتوره دارای بیشترین و کمترین میزان شباهت (بترتیب 2/99 و 8/85 درصد) با جدایه‌های همین ویروس می‌باشد که پیشتر بترتیب از گیاهان شلغم و ترب گزارش شده‌اند. به رغم مشابهت بالای ترادف نوکلئوتیدی ژنوم جدایه تاتوره با جدایه شلغم، پروتئین rep رمزشده توسط جدایه تاتوره در انتهای N-terminal دارای 14 اسیدآمینه بیشتر است. در میان نژادهای پنج گانه TCTV، جدایه تاتوره متعلق به نژاد C بوده و در کنار جدایه‌هائی قرار می‌گیرند که قبلا از گیاه شلغم یا از بدن زنجرک‌ها گزارش شده است. نتایج این تحقیق، بار دیگر دامنه میزبانی وسیع تِرنکِرتوویروس‌ها در علف‌های هرز و نقش آن­ها را در آلودگی سبزیجات تائید می‌کند.