تنوع ژنتیکی جدایه های Acidovorax oryzae عامل نوار قهوه ای برنج در استان مازندران

Abstract

بیماری نوار قهوه‌ای برنج (brown stripe of rice ) یکی از بیماری‌های شایع در خزانه‌های برنج (<em>Oryza sativa</em>) می‌باشد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی عامل نوار قهوه ای برنج، نمونه برداری، در فصول زراعی 1391-1390 از خزانه های مازندران انجام شد. عامل بیماری بر اساس آزمون‌های بیوشیمیائی، فیزیولوژیکی و بیماری‌زائی <em>Acidovorax </em> <em>avenae </em>subsp<em>. avenae ( Acidovorax oryzae</em><em>)</em> تشخیص داده شد. تعداد 90 جدایه مورد بررسی های فنوتیپی (مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و بیوشیمیائی) و الکتروفورز پروتئین های سلولی (SDS-PAGE) قرار گرفتند. از نظر خصوصیات فنوتیپی تنوعی در میان جدایه ها مشاهده نشد. نتایج به دست آمده از آنالیز خوشه ای پروتئینی سلولها، جدایه ها را در سطح تشابه 45 درصد به 2 گروه و در سطح تشابه 68 درصد به 5 گروه تفکیک کرد. جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی،DNA ژنومی جدایه ها استخراج و در واکنش زنجیره ای پلیمراز (rep-PCR) با استفاده از آغازگرهای ERIC و BOX مورد بررسی قرار گرفت. دندروگرام با روش مقایسه جفت ها از طریق میانگین های بی وزن (UPGMA) و با استفاده از نرم افزار NTSYS ترسیم گردید. آنالیز خوشه‌ای نتایج به دست‌آمده با آغازگر ERIC نشان داد که جدایه ها در سطح تشابه20 ، 35 و 65 درصد به ترتیب در 2 ، 5 و 10 گروه و با آغازگر BOX در سطح تشابه 20 ، 50 و 80 به ترتیب به 7 ، 16 و 23 گروه دسته بندی شدند. نتایج بیانگر وجود تنوع ژنتیکی بالائی در جمعیت <em>Ao</em> عامل نوار قهوه ای برنج بود