بررسی پایگاه های توالی آلرژن ها و تعیین پایگاه داده مناسب برای آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب

Abstract

براساس اعلام سازمان جهانی آلرژی؛ حدود یک سوم جمعیت جهان متاثر از آلرژی‌اند. مطابق با ضوابط سازمان جهانی سلامت ارزیابی آلرژنیسیته پروتئین‌های نوترکیب ضروری است. ارزیابی آلرژنیسیته با پیشرفت‌های بدست آمده در آنالیزهای بیوانفورماتیکی و تعیین ساختار سه بعدی آلرژن‌ها تسهیل شده است. آنالیز بیوانفورماتیکی مرحله مقدماتی در ارزیابی آلرژنیسیته پروتئین‌های نوترکیب است که نتایج آن در سنگینی مستندات و قضاوت آلرژنیسیته اهمیت دارد. کارایی آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین‌های نوترکیب وابسته به ماهیت و محتوای پایگاه‌های اطلاعاتی مورد استفاده در تحلیل است. این تحقیق با هدف بررسی و تعیین پایگاه‌های داده توالی مناسب برای آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین‌های نوترکیب انجام شد. لذا پایگاه‌های داده آلرژن پس از مطالعه تطبیقی در سه گروه الف- عمومی، ب- مولکولی و ج- آنالیز موتیف و اپی‌توپ دسته‌بندی شد. نتایج نشان داد این پایگاه‌ها در حجم داده‌ها، سازماندهی و قابلیت‌ها متفاوت هستند. به منظور دستیابی به نتایج بهتر و دقیق‌تر، آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین‌های نوترکیب باید بصورت ترکیبی و بهره-مندی از گروهی از پایگاه‌های اطلاعاتی آلرژن‌ها انجام شود. بدلیل گستره داده‌ها و الگوریتم‌های مختلف درباره پیش‌بینی آلرژنیسیته، پایگاه توالی آلرژن‌ها شامل Allergome, ADFS, SDAP, FARRP و Alegpred برای آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین‌های نوترکیب توصیه می‌شود. همچنین در این تحقیق ارزیابی بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین اسموتین انجام شد. نتایج تحقیق حاکی از آن بود که براساس آنالیزهای بیوانفورماتیکی اسموتین حساسیت‌زا است.