آنالیز فیلوژنتیک مایکوباکتریوم آویوم تحت‌گونه‌ پاراتوبرکلوزیس جدا شده از گاوداری‌های استان تهران

Abstract

بیماری یون یا پاراتوبرکلوزیس نوعی التهاب روده شدید، مزمن و پیش­رونده در نشخوارکنندگان با عامل مسبب <em>مایکوباکتریوم آویوم</em> تحت­گونه­ پاراتوبرکلوزیس می­باشد که خسارات اقتصادی فراوانی به صنعت دامپروری به­ویژه گاوداری­های شیری وارد می­کند. از سوی دیگر آن را عامل ایجاد­کننده بیماری کرون در انسان می­شناسند. این مطالعه با هدف آنالیز فیلوژنتیک <em>مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس</em> جداشده از گاوداری­های استان تهران انجام گردید. در این مطالعه از تعداد 100 نمونه مدفوع گاوهای مشکوک به بیماری یون، استخراج DNAانجام شد سپس با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن IS900واکنش Nested PCRصورت گرفت و از موارد مثبت جدا شده، 14 نمونه به­طور تصادفی برای توالی­یابی به شرکت ماکروژن کره ارسال گردید. در این مطالعه در مجموع 28 نمونه از 100 نمونه مدفوعی از نظر وجود باکتری مایکوباکتریوم آویوم تحت­گونه­ پاراتوبرکلوزیس مثبت بود. بعد از توالی­یابی نمونه‌های مثبت ملاحظه گردید که بیش از 99 درصد با توالی­های موجود در بانک ژن شباهت وجود دارد. همچنین نتایج مطالعه حاضر نشان داد که سویه­های KJ629114 وAE016958 بیشترین شباهت و سویه CP000325 بیشترین تفاوت را با جدایه­های حاصل از این مطالعه در ژن GyrAدارند. در مورد ژن GyrBنیز بیشترین شباهت مربوط به سویه­های AE016985 ،CP005928 وCP009614 و بیشترین تفاوت هم مربوط به سویه GU143884می­باشد. نتایج مطالعه نشان داد که تکنیک Nested PCRمی­تواند روش ارزشمندی برای شناسایی <em>مایکوباکتریوم آویوم</em> تحت­گونه­ پاراتوبرکلوزیس در حیوانات باشد.