بهینه‌سازی استخراج آران‌ای دو رشته‌ای ویروسی از برخی گونه‌های Fusarium

Abstract

اغلب ویروس­های آلوده­کننده­ی قارچ­های بیمارگر گیاهی که تا کنون گزارش شده­اند، دارای ژنوم آران­ای دو رشته­ای (Double Strand RNA,dsRNA) می­باشند. این نوع ویروس­ها با توجه به خاصیت کم­آزاری به عنوان یکی از عوامل کنترل بیولوژیکی قارچ­ها مطرح هستند. در این تحقیق، هشت جدایه متعلق به پنج گونه <em>Fusarium</em> شامل <em>F. graminearum</em> s. str. (lin. 7)، <em>F. culmorum</em>، <em>F. tricinctum</em>، <em>F</em>. <em>proloferatum</em> و <em>F</em>. <em>incarnatum</em> برای وجود dsRNA مورد بررسی قرار گرفتند. با توجه به وجود پروتکل­های متفاوت برای استخراج dsRNA که اغلب دارای مراحل پیچیده و استفاده از مواد خطرناک و سرطان­زا می باشند، در روش مذکور از فنول و کلروفورم استفاده نشد و ضمن استفاده از میزان بافت کمتر، مدت زمان استخراج آران­ای دورشته­ای نسبت به سایر روش­ها کاهش پیدا کرد. نهایتاً در چهار جدایه <em>Fusarium</em> پس از استخراج و الکتروفورز، وجود آران­ای دو رشته­ای مشخص شد و نتایج حاصله نشان داد روش مذکور یک روش مناسب و کارآمد برای استخراج dsRNA از بافت­ قارچی می­باشد. همچنین در این تحقیق وجود آر.ان.ای دو رشته­ای در گونه <em>F</em>. <em>incarnatum</em> (<em>F</em>. <em>semitectum</em>) برای اولین بار گزارش می­شود.