واژگونی درونگونهای در ناحیۀ psbA-trnH و تأثیر آن در بارکدگذاری: مطالعۀ موردی گروه Capparis spinosa L.
دریافت مدرک
FullText
اندازه فایل:
950.5کیلوبایتنوع فايل (MIME):
PDFنوع مدرک
Textمقاله پژوهشی
زبان مدرک
فارسیچکیده
بارکدگذاری DNA یکی از روشهای رو به گسترش در سیستماتیک مولکولی برای شناسایی گونهها است. ناحیۀ psbA-trnH یکی از متغیرترین نواحی غیر کدشوندۀ ژنوم کلروپلاستی و بارکد DNA استانداردی برای گونههای گیاهی است؛ با این حال، وجود واژگونیهای درونگونهای، استفاده از این قطعه را بهعنوان بارکد DNA مناسب محدود کرده است. در پژوهش حاضر، تأثیر این تغییرات ساختاری بر شناسایی گونههای گروه Capparis spinosa شامل C. spinosa، C. parviflora، C. mucronifolia و C. cartilaginea، بررسی شد. همردیفسازی ترادفهای این قطعه در 25 نمونه، شامل 4 گونه از این گروه و 3 گونۀ دیگر از جنس Capparis انجام شد. نتایج حاصل نشان داد چندشکلی درونگونهای در دو ناحیه از قطعۀ psbA-trnH در گروه C. spinosaوجود دارد و حدود 8 درصد از طول این ناحیه را در بر گرفته است. تحلیل دادهها نشان داد شناسایینکردن این واژگونیها منجر به تخمین بیش از حد واگرایی درونگونهای، کاهش واگرایی بینگونهای و ناتوانی توالی psbA-trnH در شناسایی تاکسونهای خویشاوند میشود و استفاده از توالی مکمل معکوس تا حدودی این مشکل را کاهش میدهد. براساس نتایج این پژوهش، پیشنهاد میشود نمونهبرداری از دامنۀ جغرافیایی وسیعی ممکن است تنوعات مولکولی درون یک گونه را بهتر نمایان کند و کارآیی یک بارکد DNA را افزایش دهد. واژههای کلیدی: Capparis spinosa، واژگونیهای درونگونهای،psbA-trnH.
کلید واژگان
واژههای کلیدی: Capparis spinosaواژگونیهای درونگونهای
psbA-trnH
شماره نشریه
38تاریخ نشر
2019-05-221398-03-01
ناشر
معاونت پژوهش و فناوری دانشگاه اصفهانUniversity of Isfahan
سازمان پدید آورنده
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایراندانشیار گروه زیستشناسی گیاهی و جانوری، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
استادیار گروه زیستشناسی، دانشکدۀ علوم، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
شاپا
2008-89062322-2190
