ارزیابی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیکی جمعیت‌های کرفس زراعی (Apium graveolense) وکرفس کوهی(Kelussia odoratissima) به روش SDS-PAGE

Abstract

مطالعه پروتئین‌ها ابزاری مناسب برای برآورد تنوع ژنتیکی و میزان شباهت بین ژنوم های مختلف است. با توجه به اهمیت دارویی و غذایی کرفس زراعی و کوهی ، در این پژوهش تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیکی 15 جمعیت کرفس زراعی و شش جمعیت کرفس کوهی بر مبنای پروتئین‌های ذخیره‌ای بذر کرفس زراعی و کوهی و پروتئین‌های برگ کرفس زراعی در سه مرحله 30، 45 و 60 روز پس از کشت با استفاده از روش SDS-PAGE مورد مطالعه قرار گرفت. حضور و عدم حضور نوار به ترتیب با یک و صفر امتیازدهی و سپس تعداد کل نشانگرهای ایجاد شده، تعداد نشانگرهای چندشکل، درصد چند شکلی نشانگرها، تعداد آلل مشاهده شده ، تعداد آلل موثر، متوسط هتروزیگوسیتی، شاخص‌ اطلاعات شانون و شاخص تنوع ژنی نی برآورد شد. همچنین تجزیه واریانس مولکولی، تجزیه به بردارهای اصلی و گروهبندی جمعیت‌ها بر اساس الگوریتم‌ Minimum Evolution و ضریب فاصلهP-Distance انجام گرفت. نتایج حاصل از این مطالعه نشان دهنده تنوع ژنتیکی بالا در هر دو جمعیت کرفس کوهی و زراعی ، متوسط هتروزیگوسی بالای بذرهای کرفس زراعی در مقایسه با بذرهای کرفس کوهی و تنوع درون جمعیتی در هر دو گیاه در مقایسه با تنوع بین جمعیتی سطح بالاتری داشت. داده های این پژوهش نشان داد در کرفس زراعی تنوع ژنتیکی از تنوع جغرافیایی تبعیت نمی کند.