بررسی بیوانفورماتیکی FLORICAULA (FLO) در گیاه زینتی بنفشه آفریقایی (Saintpaulia ionantha H.Wendl.)

Abstract

گذر مرحله رویشی به زایشی در گیاه زینتی بنفشه آفریقایی با نام علمی Saintpaulia ionantha H.Wendlبا کنترل فاکتورهایی از جمله FLORICAULA (FLO) صورت می‌گیرد. فرآیند تعیین سرنوشت مریستم گل و الگوی شکل‌گیری آن توسط ژن FLO و القای ژن‌های همئوتیک مشخص می‌شود. در این پژوهش تعیین توالی پروتئین FLO، ویژگی‌های پروتئینی، ساختار دوم، موقعیت درون-سلولی و درخت فیلوژنتیکی توسط ابزارهای بیوانفورماتیک برای نخستین‌بار در بنفشه آفریقایی مورد ارزیابی قرارگرفته است. نتایج نشان داد که موقعیت درون سلولی این پروتئین در هسته پیش بینی شده است. این پروتئین (FLO) به خانواده FLO/LFY تعلق دارد. ساختار ثانویه پروتئین 53% آلفا هلیکس و 4% صفحات بتا تشکیل شده است. بررسی درخت فیلوژنی، گونه‌های مربوط به یک خانواده در یک شاخه جای گرفتند. همچنین هم‌ترازی توالی پروتئین نشان داده است که در گیاهان هم‌خانواده توالی به‌شدت حفاظت شده است. شناسایی ویژگی‌های پروتئین FLO می‌تواند به عنوان فاکتور اصلی در برنامه‌ریزی عملکرد بافت و به دنبال آن کنترل عملکرد این پروتئین حائز اهمیت باشد.