بررسی و تحلیل فیلوژنتیکی ناحیه COXI در برخی از نژادهای بز ایرانی

Abstract

<strong>DN</strong><strong>A</strong><strong> میتوکندریایی یکی از گسترده‌ترین نشانگرهای مولکولی برای مطالعات فیلوژنتیک در حیوانات به ­علت ساختار ژنوم ساده آن است.</strong><strong>این مطالعه ویژگی‌های ژنتیکی بزهای بومی را با استفاده از تجزیه و تحلیل توالی ( </strong><strong>DNA Cytocrome oxidase I (COXI </strong><strong> برای شناسایی و تمایز بین سه نژاد (نجدی، عدنی و مرخز) ایران بررسی می‌کند. استخراج </strong><strong>DNA</strong><strong> با استفاده از روش بهینه شده نمکی انجام شد و ژن سیتوکروم اکسیداز</strong><strong> I </strong><strong>به ­روش </strong><strong>PCR </strong><strong>با یک جفت پرایمر، تکثیر گردید. درخت فیلوژنتیکی با استفاده از نرم­ افزار 6</strong><strong> Mega </strong><strong>به‌دست آمد. </strong><strong>توالی </strong><strong> </strong><strong>COXI </strong><strong>از 60 بز دارای تنوع هاپلوتیپی </strong><strong>0/47 و تنوع نوکلئوتیدی 0/0005 بود</strong><strong>.</strong><strong> تجزیه و تحلیل­ ها به ­کمک رویه </strong><strong>Composition</strong><strong> برنامه </strong><strong>Bio</strong><strong>Edit</strong><strong> نشان داد این توالی برای ناحیه </strong><strong>COXI</strong><strong> شامل </strong><strong>28/97 درصد </strong><strong>نوکلئوتید A و </strong><strong>25/52 </strong><strong>درصد نوکلئوتید </strong><strong>C و </strong><strong>15/86 </strong><strong>درصد نوکلئوتید </strong><strong>G</strong><strong> و 66/29 درصد نوکلئوتید </strong><strong>T</strong><strong> می‌باشد که نسبت</strong><strong> </strong><strong>C+G، چهل و دو درصد</strong><strong> و </strong><strong>A+T</strong><strong>، پنجاه و هشت درصد است. ارتباط تکاملی به ­وسیله درخت فیلوژنتیک نمایش داده شد.</strong><strong>درخت فیلوژنی نشان داد که بزهای ایرانی در یک شاخه جداگانه خوشه‌بندی شده است. این نتیجه به ­طور گسترده از توزیع جغرافیایی این نژاد‌ها در ایران پیروی می­ کند و می تواند در طراحی برنامه‌های حفاظت و مدیریت نژادهای بز ایرانی مورد استفاده قرار گیرد.</strong><br />