استفاده از علم بیوانفورماتیک برای تشخیص آلودگی میگو به ویروس بیماری لکه سفید

Abstract

<br /><span lang="AR-SA">ویروس سندرم لکه سفید یک عامل مهم مرگ و میر میگو پرورشی در سراسر کشورهای جهان بشمار می رود</span><span lang="FA">(</span><span class="SpellE"><span dir="ltr">Witteveldt</span></span><span dir="ltr"> et al, 2001</span><span lang="FA">) </span><span lang="AR-SA">ویریونهای غشا دار این ویروس ذرات متقارن بیضوی تا میله ای شکل با قطری بین 120 تا 150 نانومتر و طولی در حدود 270 تا 290 نانومتر هستند. انتهای دم مانندی در یک انتهای ویریون وجود دارد (</span><span class="SpellE"><span dir="ltr">Hulten</span></span><span dir="ltr"> et al., 2002</span><span lang="AR-SA">)</span><span class="GramE"><span dir="ltr">.</span></span><span lang="AR-SA"> این ویروس دارای ژنوم</span><span dir="ltr"> DNA </span><span lang="AR-SA">حلقوی دو رشته ای با طولی در حدود 305 هزار جفت باز است که در آن</span><span dir="ltr"> ORF </span><span lang="AR-SA">وجود دارد. ویروس سندرم لکه سفید، میگو و سایر سخت پوستان را آلوده می کند. ویروس دارای حداقل پنج پروتئین ویریون اصلی است که سه تا از آنها یعنی</span><span dir="ltr"> VP15, VP24, VP26 </span><span lang="AR-SA">در نوکلیوکپسید میله ای شکل و دو تای دیگر یعنی</span><span dir="ltr"> VP19, VP28</span><span lang="AR-SA">در غشا ویروس وجود دارد (Mohan et al., 2002).<br /></span><span lang="AR-SA">هیچکدام از 5 پروتئین اصلی ساختمانی این ویروس گلیکوزیله نیستند. که این یک خصوصیت غیر معمول در بین ویروس های جانوری غشا دار است (</span><span class="SpellE"><span dir="ltr">Hulten</span></span><span dir="ltr"> et al., 2000_b</span><span lang="AR-SA">)<span class="GramE">.</span><br />اگر چه ویروس لکه سفید از نظر مورفولوژی شبیه باکولوویروسهای حشرات است ولی این دو از نظر توالی های اسیدهای آمینه به هم مرتبط نیستند. حتی برخی ژنهای این ویروس همولوژی بیشتری با ژنهای یوکاریوتیک دارند. در حقیقت توالی ویروس لکه سفید با همه ویروس ها متفاوت است (</span><span dir="ltr">Yang et al., 2001</span><span lang="AR-SA">)<span class="GramE">.</span><br />مطالعات فیلوژنیک نیز نشان می دهند که پروتئین های این ویروس در ایزوله های مختلف، آن بسیار نزدیک به هم هستند. درخت فیلوژنیک این پروتئین ها را از این نظریه حمایت می کند که ویروس سندرم لکه سفید یک ویروس متمایز از سایر خانواده های ویروس می باشد و به هیچکدام از خانواده های شناخته شده فعلی تعلق ندارد (</span><span dir="ltr">Chen et al., 2002</span><span lang="AR-SA">).</span>