| dc.contributor.author | مرتضی زاده, سعید | fa_IR |
| dc.contributor.author | جمالی, یوسف | fa_IR |
| dc.contributor.author | نادری منش, حسین | fa_IR |
| dc.date.accessioned | 1399-07-09T11:53:13Z | fa_IR |
| dc.date.accessioned | 2020-09-30T11:53:13Z | |
| dc.date.available | 1399-07-09T11:53:13Z | fa_IR |
| dc.date.available | 2020-09-30T11:53:13Z | |
| dc.date.issued | 2020-09-22 | en_US |
| dc.date.issued | 1399-07-01 | fa_IR |
| dc.date.submitted | 2018-12-03 | en_US |
| dc.date.submitted | 1397-09-12 | fa_IR |
| dc.identifier.citation | مرتضی زاده, سعید, جمالی, یوسف, نادری منش, حسین. (1399). شبیه‌سازی رفتار فاز لیپیدی L_α با استفاده از درشت‌دانه‌سازی سامانمند مولکول dioleoylphosphatidylethanolamine. مجله پژوهش‌های سلولی و مولکولی
(مجله زیست شناسی ایران), 33(3), 325-336. | fa_IR |
| dc.identifier.issn | 2383-2738 | |
| dc.identifier.issn | 2383-2746 | |
| dc.identifier.uri | http://cell.ijbio.ir/article_1448.html | |
| dc.identifier.uri | https://iranjournals.nlai.ir/handle/123456789/411049 | |
| dc.description.abstract | در میان انواع مختلف فازهای لیپیدی، ساختار لایه‌ای از اهمیت ویژه‌ای در درک فرآیندهای مرتبط با غشای سلولی اعم از همجوشی غشای لیپیدی برخوردار است. ازاین‌رو تحقیق در مدل‌سازی فاز L_α لیپیدی، بخش قابل‌توجهی از شبیه‌سازی ماکرومولکول‌های زیستی را به خود اختصاص داده است. در این تحقیق از درشت‌دانه‌سازی سامانمند به‌منظور مدل‌سازی فاز لایه‌ای مولکول لیپید dioleoylphosphatidylethanolamine (DOPE)-1،2 استفاده کرده‌ایم. مدل درشت‌دانه بدون حلال بوده و مولکول لیپید از ۱۴ دانه تشکیل می‌شود به‌طوری‌که انرژی پتانسیل سیستم شامل جملات پیوندی، غیر پیوندی و الکتروستاتیک هست. مدل‌سازی از روی شبیه‌سازی اتمی مولکول‌های لیپید در محتوای آبی %۴۴٫۶ وزنی-وزنی با استفاده از روش معکوس بولتزمن تکرارشونده و مونت‌کارلو معکوس انجام گرفت. اگرچه همگرایی مناسب در توابع توزیع پیوندی و زاویه‌ای در پایان فرآیند معکوس بولتزمن تکرارشونده حاصل گردید، اما همگرایی دقیق در توابع توزیع پیچشی و توابع توزیع شعاعی در پایان مونت‌کارلو معکوس بدست آمد. با استفاده از پتاسیل‌های حاصله، فاز لایه‌ای L_α در کمتر از 10 نانوثانیه بدست آمد. علاوه بر این، پتانسیل‌های درشت‌دانه قادر به مدل کردن همجوشی چندلایه‌ی لیپیدی و ساختار حد واسط ذرات لیپیدی هستند. | fa_IR |
| dc.language | فارسی | |
| dc.language.iso | fa_IR | |
| dc.publisher | انجمن زیست شناسی ایران | fa_IR |
| dc.publisher | Iranina Biology Society | en_US |
| dc.relation.ispartof | مجله پژوهش‌های سلولی و مولکولی
(مجله زیست شناسی ایران) | fa_IR |
| dc.relation.ispartof | Journal of Cellular and Molecular Research
(Iranian Journal of Biology) | en_US |
| dc.subject | دینامیک مولکولی | fa_IR |
| dc.subject | درشت‌دانه‌سازی | fa_IR |
| dc.subject | معکوس بولتزمن تکرارشونده | fa_IR |
| dc.subject | مونت‌کارلو معکوس | fa_IR |
| dc.subject | بیوفیزیک | fa_IR |
| dc.title | شبیه‌سازی رفتار فاز لیپیدی L_α با استفاده از درشت‌دانه‌سازی سامانمند مولکول dioleoylphosphatidylethanolamine | fa_IR |
| dc.type | Text | en_US |
| dc.type | مقاله پژوهشی | fa_IR |
| dc.contributor.department | گروه بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، داشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران | fa_IR |
| dc.contributor.department | دانشکده ریاضی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران | fa_IR |
| dc.contributor.department | استاد دانشگاه | fa_IR |
| dc.citation.volume | 33 | |
| dc.citation.issue | 3 | |
| dc.citation.spage | 325 | |
| dc.citation.epage | 336 | |
