بررسی تنوع ژنتیکی موجود در مولکول‌های کلیدی سیستم تشخیص الگو ( گیرنده‌های شبه‌تول دو و چهار) در نمونه های سرطان معده

Abstract

مقدمه: سرطان معده دومین بدخیمی شایع و عامل اصلی مرگ و میر در کشور است. با در نظر گرفتن آمار جهانی این ارقام بسیار نگران کننده بوده و اهمیت مطالعات در حوزه سرطان معده را برجسته می‌کند. از آنجایی که سال‌هاست نقش التهاب مزمن در ایجاد سرطان به خصوص سرطان‌های مرتبط با عفونت مانند سرطان معده مشخص شده است، تمرکز بر مولکول‌های دخیل در این فرآیندها می‌تواند راهگشا باشد. در این میان Toll-like-receptors (TLRs) بزرگترین خانواده گیرنده الگوهای مولکولی مرتبط با التهاب بوده و تاثیر جهش‌های ایجاد شده در TLR2 و TLR4 در پاتولوژی سرطان معده مشخص شده است. با در نظر گرفتن مطالعات پیشین و نقش عمده TLR4 و TLR2 در فرآیندهای التهابی پیش بدخیمی، در این مطالعه نیز در دو مرحله‌ی آزمایشگاهی و بیوانفورماتیکی به بررسی جهش موجود در توالی ژن ­های مذکور و ارتباط آن با سرطان معده پرداخته شده است.

مواد و روش­ ها: در این مطالعه تعداد 30 نمونه بافت سرطان معده آلوده به هلیکوباکترپیلوری جمع آوری شد و پس از استخراج DNA، با استفاده از روش‌های تعیین توالی سنگر و پیش بینی بیماری توسط SIFT، PolyPhen وضعیت پاتوژنی آنها بررسی شد. همچنین توسط PyMOL مدل سازی سه بعدی رسپتور- لیگاند (قبل و بعد از جهش) انجام شد.

یافته ­ها: داده‌ها جهش هتروزیگوتc.1061A>G در اگزون سوم ژن کد کننده‌ی TLR4 را نشان دادند. با مدل سازی سه بعدی پروتئین مربوطه دارای این جهش نیز مشخص شد که ناحیه‌ی متأثر از جهش خارج از منطقه‌ی میانکش گیرنده مورد بررسی با LPS بوده و بنابراین پاتوژن نمی‌باشد.

بحث و نتیجه ­گیری: در مجموع نتایج این پژوهش نشان داد که جهش های اتفاق افتاده بر روی دو ژن مهم سیستم تشخیص الگو در نمونه­های سرطانی ایران ارتباط عملکردی با این دو پروتئین نداشته است.