خوشه بندی مبتنی بر آنتولوژی ژن های هدف ریزRNA های مؤثر بر تولید شیر

Abstract

<strong>شیر گاو مایعی بسیار مغذی است و بخش مهمی از رژیم غذایی یک فرد می­ باشد و تمامی مواد مورد نیاز بدن انسان را در خود دارد. استراتژی­ هایی که از طریق آن می­ توان تولید شیر را تحت تأثیر قرار داد، شناسایی ژن­ هایی که روی تولید و ترکیب شیر اثر می­ گذارند و استراتژی دیگر شناسایی ریز</strong><strong>RNA</strong><strong>هایی ­که بیان ژن­ های مؤثر را تحت تأثیر قرار می ­دهند</strong><strong>.</strong><strong> در این مطالعه ابتدا داده ­های ریز</strong><strong>RNA­</strong><strong>های مربوط به غده پستانی گاو شیری با کد شناسایی</strong><strong> E-GEOD-61227</strong><strong>از پایگاه </strong><strong>GEO</strong><strong> پیاده­ سازی شدند. بعد از مشخص شدن میزان بیان ریز</strong><strong>RNA</strong><strong>ها، شناسایی ژن­ های هدف ریز</strong><strong>RNA </strong><strong>ها به کمک پایگاه داده ­ای </strong><strong>miRwalk</strong><strong> انجام گردید. سپس برای فرآیند خوشه ­بندی ژن ­ها بر مبنای ساختار درختی آنتولوژی ژن که شامل سه زیر آنتولوژی فرآیند بیولوژیکی، عملکرد ملکولی و جزء سلولی است از نرم­ افزار </strong><strong>AgriGO</strong><strong> استفاده گردید. در مطالعه حاضر براساس خوشه بندی مبتنی بر آنتولوژی ژن ­های هدف نتایج نشان داد که فعالیت ­های بیولوژیکی مورفوژنز بافت پستانی و تکثیر سلول­ های اپیتلیال در سطح بسیار معنی ­داری می ­باشند که این فرآیندها در تکامل و توسعه غدد پستان نقش بسیار مهمی دارند و نتایج براساس فعالیت مولکولی نشان داد که سیگنال ­دهی با استفاده از پروتئین ­های گیرنده کینازی بیش ­ترین سطح معنی­ داری به خود اختصاص داده است. هم­ چنین نتایج مربوط به بخش اجزا سلولی نشان داد بیش ­ترین شمار ژن ­های هدف در بخش داخلی غشا سلولی ارگانل و غشا پلاسمایی قرار دارند. بنابراین، ژن ­های هدفی که تنظیم کننده این فرآیندهای معنی­ دار می ­باشند پتانسیل ایفای نقش قابل توجه جهت یافتن راهکاری هدفمند در راستای بهبود صفت تولید شیر را دارند.</strong>