بیان افتراقی ژن‌های HSP90 و AGO1 و AGO4 گوجه فرنگی در مواجهه با ویروس موزاییک خیار

Abstract

ویروس موزاییک خیار Cucumber mosaic virus (CMV) گونه شاخص جنس Cucumovirus از خانواده Bromoviridae است. در این تحقیق بیان برخی ژن‏های مرتبط با رشد و نمو و متیلاسیون در یک رقم حساس گوجه‏فرنگی آلوده به ویروس موزاییک خیار بررسی شد. برای آلوده سازی گوجه فرنگی از همسانه‌های آلوده‌گر جدایه استاندارد Fny ویروس موزاییک خیار استفاده شد. بدین منظور پس از تهیه نسخه‌های رونویسی شده از همسانه‌های آلوده‌گر آران‌ای یک، دو و سه ویروس موزاییک خیار، رونوشت‌ها ابتدا روی توتون در مرحله چهاربرگی مایه زنی شدند و پس از ظهور علائم و ایجاد آلودگی، عصاره گیاه آلوده بصورت مکانیکی روی گوجه ‏فرنگی در مرحله چهاربرگی مایه زنی شد. پس از بروز علائم در چندین مرحله از گیاهان آلوده در فاصله‌های زمانی 7، 14 و 21 روز نمونه‏برداری از برگ-های آلوده انجام گرفت. پس از استخراج آران‌ای کل از گیاهان دارای علائم حضور ویروس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروس منطبق بر بخشی از ژن پروتئین پوششی تایید شد. بیان برخی از ژن‏های مرتبط با دفاع و متیلاسیون مانند Hsp90، AGO1 و AGO4 توسط Real Time PCR اندازه گیری شد. نتایج نشان داد که میزان بیان برخی از ژن‌ها مانند HSP90 در گوجه‏ فرنگی‌های آلوده کاهش یافته بود. همچنین تجزیه و تحلیل داده‏ها نشان داد سایر ژن‏ها مانند AGO1، AGO4 در گیاهان آلوده به ویروس موزاییک خیار، 14و 21 روز پس از آلودگی، افزایش بیان ژن بیشتر از روز 7 بود که ناشی از فعالیت دفاعی بیشتر میزبان در مقابل آلودگی ویروس می‏باشد.