الکتروفورز افقی پلی‌اکریل‌آمید با استفاده از چاهک‌های ژل‌آگارز

Abstract

الکتروفورز افقی ژل‌آگارز، یکی از ابزارهای پایه در زیست‌شناسی مولکولی است. این روش آسان و سریع بوده، استفاده از آن نیاز به مهارت زیادی ندارد. یکی از معایب ژل‌آگارز این است که جداسازی قطعات کوچک DNA با تفاوت­های ناچیز در حد چند جفت باز و همچنین تفکیک قطعات کوچک مولکول­های DNA و پروتئین در این ژل به‌خوبی امکان‌پذیر نیست که به‌طور متداول در این موارد از ژل پلی‌اکریل‌آمید استفاده می­شود. الکتروفورز عمودی ژل پلی‌اکریل‌آمید علی­رغم مزایایی که دارد ولی روشی پیچیده، گران و زمان‌بر می­باشد. اخیراً روشی برای الکتروفورز ژل پلی‌اکریل‌آمید به‌صورت افقی معرفی شده است که ضمن داشتن مزایا نسبت به روش عمودی، ولی نیازمند ساخت دستگاهی جدید جهت انجام عمل الکتروفورز می­باشد. در این پژوهش از دستگاه الکتروفورز افقی ژل‌آگارز با اندکی تغییرات، به‌منظور انجام الکتروفورز ژل پلی­اکریل­آمید برای قطعات DNA تکثیر شونده توسط نشانگرهای ریزماهواره­ای استفاده شد. در این روش عمل الکتروفورز ژل پلی‌اکریل‌آمید، به‌صورت افقی و با استفاده از ژل دو قسمتی آگارز و پلی‌اکریل‌آمید انجام شد. نتایج نشان داد باندهای حاصل از الکتروفورز کاملاً شفاف و واضح می­باشند. همچنین در این روش، مشکلات تشکیل حباب در ژل و پارگی ژل، در هنگام جداسازی شیشه از ژل، وجود ندارد. دستگاه الکتروفورز معرفی شده، دو منظوره است که می­توان از آن هم برای ژل آگارز و هم برای ژل پلی‌اکریل‌آمید استفاده نمود.