بررسی کمی و کیفی DNA بلدرچین، استخراج شده با روش نمکی تغییر یافته و توالی¬یابی ژنومی آن

Abstract

استخراج DNA به­صورت خالص، پایدار و با کمیت و کیفیت مناسب، گام مهمی در اجرای پژوهش­های بیولوژیکی می­باشد. در این پژوهش، DNA مربوط به نمونه خون 600 بلدرچین ژاپنی با روش نمکی تغییر یافته با پودر رختشویی و بدون استفاده از آنزیم پروتئیناز K استخراج شد. نمونه­های DNA به­دست آمده در مراحل آماده­سازی کتابخانه ژنومی، با نانودراپ، فلئورومتر، بیوآنالیزر، الکتروفورز، PCR، هضم با آنزیم­های آندونوکلئاز، اتصال برچسب و آدابتور و در نهایت با توالی­یابی کل ژنوم کنترل کمی و کیفی گردید. متوسط مقدار DNA استخراج شده با متوسط میزان نسبت جذب نور در 260 به 280 نانومتر برای هر نمونه­ به­ترتیب 138 میکروگرم و 87/1 بود. فرآیندهای تکثیر، هضم، اتصال برچسب و آدابتور و توالی­یابی ژنومی همه نمونه­های DNA مورد استفاده با موفقیت کامل همراه بود. بر اساس نتایج مشخص شد که نمونه­های مذکور از کمیت، کیفیت، قابلیت و پایداری لازم و حداقل آلودگی برخوردار بودند. این روش استخراج DNA به سادگی، سریع، ایمن و با حداقل هزینه انجام پذیرفت.