بررسی فیلوژنتیکی و تکاملی توالی ژن میوستاتین شتر ترکمن در مقایسه با عملکرد این ژن در گونه‌های دیگر

Abstract

<strong>زمینه مطالعاتی: </strong>حدود 2 هزار نفر از 150 هزار نفر جمعیت شتر ایران در استان گلستان پرورش داده می‌شوند که هدف عمده نگهداری آنها گوشت و شیر می‌باشد. میوستاتین یا فاکتور تمایز 8 (GDF8) از خانواده فاکتورهای تمایز رشد بتا (TGF-β)، عامل محدود شدن توده عضلات اسکلتی می‌باشد، بنابراین جهش در این ژن می‌تواند باعث نوسانات شدید در تولید گوشت لخم در گونه‌های دامی گردد. <strong>هدف: </strong>این تحقیق با هدف بررسی توالی ژن میوستاتین با رویکرد بررسی تعیین روابط تکاملی نوکلئوتیدهای آن و نحوه عمل انتخاب طبیعی بر روی توالی نوکلئوتیدها و در نتیجه توالی اسیدهای آمینه پروتئین میوستاتین شتر ترکمن ایرانی با سایر گونه‌ها صورت گرفته است. <strong>روش کار: </strong>در این تحقیق برای اولین بار ژنوم کامل یک نفر شتر ترکمن بر اساس توالی‌یابی Hiseq 2000 شرکت ایلومینا انجام گرفت. با استفاده از روش Denovo حدود 235978 موارد کانت شده بدست آمد که با استفاده از خوانش منطقه‌ای، مورد کانت شده مربوط به ژن میوستاتین مشخص گردید. با بررسی هم‌ترازی توالی کامل ژن،‌ اگزون‌ها و توالی‌اسید آمینه‌ای آن درخت‌های فیلوژنتیک تهیه گردید. <strong> نتایج: </strong>مقایسه توالی میوستاتین شتر ترکمن ایرانی و سایر گونه‌های شتر نشان داد که از لحاظ تکاملی این ژن ‌بین شترهای دوکوهانه و تک‌کوهانه عربی قرار می‌گیرد. تفاوتی بین توالی پروتئین در هیچکدام از شترهای مورد بررسی مشاهده نشد که دلیل آن وجود جهش‌ها در نواحی اینترون ژن و یا مترادف بودن جهش‌های اتفاق افتاده، می‌باشد. <strong>نتیجه‌گیری نهایی: </strong>در بررسی ژن میوستاتین، علیرغم اینکه بین توالی نوکلئوتید اینترون و اگزون‌های ژن در این خانواده بین 1 تا 104 نوکلئوتید تفاوت وجود دارد، در توالی اسیدهای آمینة پروتئین این ژن تفاوتی مشاهده نگردید که نشان‌دهنده حفاظت کامل پروتئین این ژن طی دوره تکاملی می‌باشد. مقایسه شتر ترکمن ایرانی با سایر گونه‌ها نشان داد که گونه‌های شتر در یک گروه و در نزدیکی گونه اسب، انسان، گوسفند و بز قرار می‌گیرند.