شناسایی ژن‌های متفاوت بیان شده در جوجه‌های آلوده به ویروس H5N1 با استفاده از فرا‌تحلیل داده‌های ریزآرایه DNA

Abstract

پیدا کردن نیم‌رخ بیان ژنی در طول سال­های اخیر، منجر به شناسایی ژن­های خاص در پاسخ به بیماری­های گوناگون شده­است. یکی از این بیماری­های مهم در صنعت طیور، بیماری آنفولانزا است. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی ژن­های موثر در بروز آنفولانزای ناشی از ویروس H5N1 با استفاده از فرا­تحلیل دو مجموعه داده­ ریزآرایه DNA که بیان ژن­های میزبان در پاسخ به آنفولانزا را مورد بررسی قرار داده بودند، بود. فراتحلیل نشان داد که ژن­های STK17B، CCL4، MCM9، IRF7 و IL6 با روش­های Fisher، AW و maxP متمایز بیان می‌شوند. برای تایید تمایز بیان ژن­های شناسایی شده در آزمایشگاه از Real-time PCR استفاده شد. بدین منظور از نمونه­هایی استفاده شد که پیش­تر با ویروس H5N1 چالش داده شده بودند. نتایج برای هر پنج ژن انتخابی، تمایز بیان آنها را در حالت مواجهه با آلودگی و حتی جهت تنظیمی بیان را که در فرا­تحلیل مشاهده شده بود، در سطوح معنی­دار تایید نمود، به گونه­ای که ژن­های IL6، IRF7 و CCL4 افزایش بیان و ژن­های STK17B و MCM9 کاهش بیان نشان دادند. این نتایج پیشنهاد می­دهند فرا­تحلیل روشی بسیار قوی در شناسایی ژن­هایی است که ممکن است در پژوهش­های انفرادی مورد توجه قرار نگیرند. این ژن­ها ممکن است نقش حیاتی در تنظیم پاسخ میزبان ایفا نمایند.