چندشکلی و بیان دو پروتئین LysM-RLK در سیب زمینی قبل و بعد از بروز بیماری بلایت زودرس

Abstract

<strong>چکیده</strong> گیرنده­های (LysM-RLKs) Lysin Motif Receptor-like Kinases، به­ دلیل وجود موتیف لیزین ((LysM، به کیتین آزاد شده از دیواره­ی قارچ­ها متصل و سبب فعال شدن آبشاری از پروتئین­ها و در نهایت سبب افزایش مقاومت به پاتوژن­ها می­شوند. برای بررسی بیان LysM-RLKs احتمالی ژنوم سیب زمینی در یک رقم حساس (Russet Burbank) و یک ژنوتیپ نسبتاً مقاوم (F06037) به <em>Alternaria solani</em>، میزان بیان و توالی LysM آنها به روش­های بیوانفورماتیکی و مولکولی مطالعه شد. در مجموع 35 پروتئین LysM-RLKs در ژنوم سیب زمینی شناسایی شد که از این تعداد، 26 پروتئین بدون LysM و تعداد پنج وچهار پروتئین به ترتیب دارای یک یا دو LysM بودند. از نه گیرنده LysM-RLKs ، تعداد دو گیرنده LysM-RLKs در اثر آلودگی­ به <em>A. solani</em> افزایش بیان نشان دادند. پروتئین PGSC0003DMP400061331 با دو LysM بیان بیشتری در مقایسه با پروتئین PGSC0003DMP400060418 با یک LysM داشت. این پروتئین­ها به ترتیب با پروتئین CERK1 آرابیدوپسیس (AB367524) 98 و 81 درصد شباهت داشتند. همردیفی ناحیه­ی LysM این دو پروتئین با یکدیگر و با ناحیه­ی همولوگ در پروتئین CERK1 آرابیدوپسیس نشان داد که دو LysM پروتئین PGSC0003DMP400061331 در دو رقم تفاوتی نداشتند، اما در LysM اول پروتئین PGSC0003DMP400061331 یک ناحیه به توالی "NRD" وجود دارد که در LysM دوم همین پروتئین و پروتئین CERK1 آرابیدوپسیس دیده نمی­شود و به نظر می­رسد که حاصل حذف یا اضافه شدگی باشد. با انجام روش­های ویرایش ژنوم می­توان نقش این ژن­ها را در موضوع مقاومت یا حساسیت به قارچ <em>A. solani</em>مشخص نمود و از نتایج حاصل برای تولید گیاهان تراریخت مقاوم استفاده کرد.

<strong> </strong>