نمایش مختصر رکورد

dc.contributor.authorمرتضوی, امینfa_IR
dc.contributor.authorرشیدی, امیرfa_IR
dc.contributor.authorقادری-‌زفره‌ئی, مصطفیfa_IR
dc.contributor.authorمرادی, پرهامfa_IR
dc.contributor.authorرزم کبیر, محمدfa_IR
dc.date.accessioned1399-07-09T08:32:46Zfa_IR
dc.date.accessioned2020-09-30T08:32:46Z
dc.date.available1399-07-09T08:32:46Zfa_IR
dc.date.available2020-09-30T08:32:46Z
dc.date.issued2018-08-23en_US
dc.date.issued1397-06-01fa_IR
dc.date.submitted2017-11-15en_US
dc.date.submitted1396-08-24fa_IR
dc.identifier.citationمرتضوی, امین, رشیدی, امیر, قادری-‌زفره‌ئی, مصطفی, مرادی, پرهام, رزم کبیر, محمد. (1397). مدل‌سازی شبکۀ‌ ژنی و کاوشگری در برخی از بافت‌های گونۀ گاو با استفاده از داده‌های ریزآرایۀ DNA. علوم دامی ایران, 49(2), 297-310. doi: 10.22059/ijas.2018.245955.653583fa_IR
dc.identifier.issn2008-4773
dc.identifier.issn2423-7949
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.245955.653583
dc.identifier.urihttps://ijas.ut.ac.ir/article_67982.html
dc.identifier.urihttps://iranjournals.nlai.ir/handle/123456789/343563
dc.description.abstractهدف از این پژوهش، شناسایی ژن‌ها و کاوشگرهای هاب ناشی از ایجاد شبکه‌های بیزی در داده­های بیان ژن  و کاوشگری در بافت‌های مختلف گونۀ گاو با استفاده از داده‌های ریزآرایۀ DNA بود. با استفاده از داده­های خام بیان ژن و کاوشگری در هر بافت، ژن‌ها و کاوشگرهایی که عامل بیشترین میزان واریانس بیان ژن بودند، شناسایی‌شده و سپس شبکۀ بیزی، برای آن‌ها برازش داده شد. ژن­ها و کاوشگرهای هاب با استفاده از نسبت فراسنجه­های درجۀ درون و بیرون شناسایی شدند. اندازۀ پوشش مارکفی در شبکه­های مختلف متفاوت بود که به‌احتمال بیانگر وجود زیرساختارهای ساختارشناختی (توپولوژیکی) برای شبکه­های یادشده در بافت­های مختلف است. در روش شبکۀ ژن محور­، در بافت ماهیچۀCBR1 ،LOC788826 ، در بافت پستانیNID2 ، COL5A2، LOC616942،FXYD3 ، در بافت کبدی LOC100132279،MGC127133 ، MBOAT2،CLDN2 ، ANKRD1، در بافت رحم IGFBP1، DGAT2، CKMT1، ISG15، CKMT1 و در بافت تخمدانLOC286871  وINHBA  به‌عنوان ژن‌های هاب شناسایی شدند. هم­چنین در روش ایجاد شبکۀ کاوشگر محور، مشخص شد که دو ژن JSP.1 و BOLA-DQB در بافت­های کبد و رحم فعال هستند. ولی این ژن­ها در روش ژن محور در ایجاد شبکۀ ژنی به‌عنوان ژن هاب استخراج نشدند.fa_IR
dc.format.extent427
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.languageفارسی
dc.language.isofa_IR
dc.publisherپردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهرانfa_IR
dc.relation.ispartofعلوم دامی ایرانfa_IR
dc.relation.ispartofIranian Journal of animal Scienceen_US
dc.relation.isversionofhttps://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.245955.653583
dc.subjectتوپولوژیfa_IR
dc.subjectشبکۀ بیزیfa_IR
dc.subjectهابfa_IR
dc.titleمدل‌سازی شبکۀ‌ ژنی و کاوشگری در برخی از بافت‌های گونۀ گاو با استفاده از داده‌های ریزآرایۀ DNAfa_IR
dc.typeTexten_US
dc.typeمقاله پژوهشیfa_IR
dc.contributor.departmentدانشجوی دکتری، ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایرانfa_IR
dc.contributor.departmentاستاد، ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایرانfa_IR
dc.contributor.departmentاستادیار زیست سامانه‌های محاسباتی، گروه علوم دامی دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایرانfa_IR
dc.contributor.departmentدانشیار رایانه، گروه مهندسی کامپیوتر، دانشگاه کردستان، سنندج، ایرانfa_IR
dc.contributor.departmentدانشیار، ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایرانfa_IR
dc.citation.volume49
dc.citation.issue2
dc.citation.spage297
dc.citation.epage310


فایل‌های این مورد

Thumbnail

این مورد در مجموعه‌های زیر وجود دارد:

نمایش مختصر رکورد