سالیتون‌های توپولوژیک در مولکول DNA با پتانسیل اصلاح یافته

Abstract

مولکول DNA نه تنها از دیدگاه زیست شناسان دارای اهمیت فراوان زیستی است بلکه مورد جالبی برای مطالعه فیزیکدان‌ها نیز می‌باشد. حالت‌های باز ( Open state: حالتی که در آن پایه‌های دو رشته از یکدیگر جدا شده و باعث باز شدن بخشی از دو رشته از هم می‌شوند.) در مارپیچ دوتایی مولکول DNAقابل مدلسازی با سالیتون‌های توپولوژیک هستند. از آنجایی که این مولکول دارای طول بسیار بلند (در حدود متر) و عرض بسیار کوچک (در حدود نانو متر) است سالیتون‌های ایجاد شده قادر خواهند بود در امتداد رشته DNA حرکت کنند. دراین مقاله با پیشنهاد یک جمله اصلاحی در پتانسیل برهم‌کنش میان دو رشته‌‌ این مولکول در مدل استاندارد یاکوشویچ، پس از تشکیل هامیلتونی به بررسی رابطه پاشندگی وحل عددی معادلات با معرفی شیوه‌ای نوین پرداخته‌ایم و پاسخ‌های حاصل از جمله‌‌ اصلاحی و انرژی سالیتون‌های پاسخ را با پاسخ‌های پیشین مقایسه نموده‌ایم.