بررسی تنوع فنوتیپی و ژنوتیپی اروینیاهای پکتولیتیک جدا شده از میزبان‌های زینتی در بخش‌هایی از شمال ایران

Abstract

<strong>طیف وسیعی از باکتری‌های پکتولیتیک سبب خسارت به گیاهان زینتی می‌شوند. شناسایی دقیق عامل بیماری و بررسی تنوع فنوتیپی و ژنوتیپی باکتری‌ها، برای اعمال روش‌های کنترل مؤثر، ضروری است. تعداد 38 جدایه باکتری از برگ و قسمت‌های گوشتی گیاهان زینتی از گلخانه‌های مختلف استان‌های گیلان، گلستان، شرق مازندران و شهر مشهد جداسازی شد. جدایه‌ها از نظر ویژگی‌های فنوتیپی، بیماری‌زایی، نقوش الکتروفورزی پروتئین‌های سلولی و انگشت نگاری </strong><strong>DNA</strong><strong>ی ژنومی مورد مقایسه قرار گرفتند. بر اساس خصوصیات فنوتیپی افتراقی، جدایه‌ها در جنس‌های </strong><strong><em>Pectobacterium</em></strong><strong><em>، </em></strong><strong><em>Dickeya</em></strong><strong>و بینابین آنها قرارگرفتند. در آنالیز عددی خصوصیات بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی افتراقی، جدایه‌های منتسب به جنس‌های بالا در 12 گروه دسته‌بندی شدند. جدایه‌های گیاهان زینتی در الگوی پروتئین‌های سلولی متنوع بودند. این روش در دسته‌بندی مقدماتی جدایه‌ها مفید بود. با به کارگیری آغازگرهای </strong><strong>ERIC</strong><strong>، </strong><strong>REP</strong><strong> و </strong><strong>BOX</strong><strong>، قطعات </strong><strong>DNA</strong><strong> ی ژنومی جدایه‌های نماینده به همراه 11 جدایه استاندارد تکثیر و الکتروفورز گردید. بر اساس الگوی به دست آمده از هر سه آغازگر، جدایه‌های گیاهان زینتی با اختلاف زیادی در کنار استانداردها گروه‌بندی شدند.</strong><strong>به نظر می‌رسد </strong><strong>rep- PCR</strong><strong> در گروه‌بندی جدایه‌های اروینیای پکتولیتیک از قابلیت کافی برخوردار نیست.</strong>