پویش کل ژنوم هشت نژاد گاو بومی ایران برای شناسایی نشانه های انتخاب
(ندگان)پدیدآور
فروغ عامری, نادراسدی فوزی, مسعوداسمعیلی زاده کشکوئیه, علینوع مدرک
Textمقاله پژوهشی
زبان مدرک
فارسیچکیده
در تحقیق حاضر، قسمتهایی از ژنوم گاوهای بومی ایران که شواهدی از انتخاب برای جهشهای مختلف را نشان میدهند، شناسایی شد. بدین منظور از دادههای 777962 نشانگر چندشکلی تکنوکلئوتید پراکنده در سرتاسر ژنوم و 90 حیوان از هشت نژاد گاو بومی ایران (سرابی، کرمانی، سیستانی، نجدی، کردی، تالشی، پارس و مازندرانی) برای شناسایی نشانههای انتخاب استفاده شد. بررسی تمایز جمعیتی با استفاده از روش شاخص تثبیت (Fst) تصحیح شده برای اندازه نمونه (θ) نشان داد که در چندین مکان ژنی شواهدی از انتخاب در این هشت نژاد وجود دارد. در طول 30 کروموزوم گاو، تعداد هفت ناحیه ژنومی شناسایی شد که نشانههای انتخاب در آنها وجود داشت. این نواحی بر روی کروموزومهای یک، دو، هفت، هشت، 12، 13 و X واقع بودند. بررسی ژنها و QTL های پیشین گزارش شده در مکانهایی از ژنوم گاو که تحت تأثیر انتخاب بودهاند، نشان داد که این مکانها با ژنها و QTL های صفات مهم اقتصادی نظیر صفات مرتبط با تولید و اجزای شیر، وزن بدن، مقاومت به سرما و صفات تولیدمثل مرتبط هستند. نتایج تحقیق حاضر، اطلاعات مفیدی از وجود تنوع ژنتیکی و نشانه های انتخاب در گاوهای بومی ایران فراهم کرد.
کلید واژگان
تفرق جمعیتشاخص تثبیت
کاوش ژنومیک
گاو بومی ایران
نشانه انتخاب
شماره نشریه
2تاریخ نشر
2016-06-211395-04-01
ناشر
دانشگاه تهران، پردیس ابوریحانUniversity of Tehran, College of Abureyhan
سازمان پدید آورنده
دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایراندانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
شاپا
2009-67762382-994X




