شناسایی، توالی‌یابی و تعیین پروتئین استنباطی ژن هم‌ساخت APETALA1 (AP1) درخردل سیاه (Brassica nigra)

Abstract

گذر به ‌گل‌دهی یک تغییر فاز بزرگ در چرخه‌ی زندگی گیاهان است. ژن APETALA1 در پیش‌برد مرحله‌ گذر ونیز تعیین هویت مریستم گل نقش ایفا می‌کند. این پژوهش با هدف طراحی پرایمر، استخراج، شناسایی و تعیین توالی این ژن در گیاه خردل سیاه (Brassica nigra)انجام شد. RNA کل از گل‌های بالغ استخراج و برای ساخت cDNA استفاده گردید. آغازگرهای اختصاصی بر اساس توالی ژن‌های هم‌ساخت AP1 در گیاهان هم خانواده در سایت NCBI طراحی و در واکنش RT-PCR استفاده گردید. محصول این واکنش پس از خالص سازی تعیین توالی‌ شد. نتایج نشان دهنده‌ی تکثیر قطعه‌ی مورد نظر از ژن به طول 618 نوکلئوتید بود که BniAP1 نام‌گذاری شد و در پایگاه NCBI ثبت گردید. مقایسه‌ی توالی پروتئین استنباطی BniAP1 با سایر هم‌ساخت‌های AP1 نشان دهنده‌ی شباهت بین 60 تا 91 درصدی این توالی با توالی‌های مشابه بود و این قطعه دارای 206 آمینواسید است. مطابق با این نتایج می‌توان پیشنهاد داد که BniAP1 نیز به عنوان هومولوگ AP1 در گذر به گل‌دهی نقش دارد و می‌تواند به عنوان ژن تعیین هویت مریستم گل عمل کند.