ارزیابی ژن nifH در باکتری مزوریزوبیوم سیسری سویه بومی ایران

Abstract

<em>سابقه و هدف:</em> نخود سومین لگوم دانه ای جهان و اولین لگوم دانه ای ایران است. بررسی اثر متقابل <em>مزوریزوبیوم سیسری</em> همزیست با این گیاه در تثبیت ازت مولکولی اهمیت زیادی دارد. تثبیت نیتروژن اتمسفری مستلزم وجود سیستم آنزیمی نیتروژناز است که توسط سه ژن <em>nifH</em>، <em>nifD</em> و <em>nifK</em> کد می شود. هدف از این پژوهش تعیین توالی ژن <em>nifH</em>، کد کننده زیر واحد گامای آنزیم نیتروژناز مقایسه آن با ژن های مشابه در سایر ریزوبیوم ها می باشد. <em>مواد و روش ها:</em> پس از جداسازی سویه های بومی <em>مزوریزوبیوم</em> و کشت آنها، استخراج DNA برای تهیه DNA الگو انجام شد. سپس پرایمرهای مناسب و اختصاصی برای ژن <em>nifH</em> طراحی و پس از بهینه سازی شرایط آزمایش PCR به منظور تکثیر قطعه ژن <em>nifH</em>، توالی ژنی آن مورد بررسی قرار گرفت. <em>یافته‌ها</em>: باکتری <em>مزوریزوبیوم سیسری</em> در محیط کشت YMA کلنی‌های صورتی تا سفید با حاشیه صاف ایجاد نمود. با استفاده از دو جفت پرایمر nifH1/nifH2 توالی حدود 770 و nifH4/nifD1 توالی 1800 جفت بازی از این ژن تکثیر و تعیین توالی انجام گردید. <em>نتیجه گیری:</em> مقایسه توالی ژن <em>nifH</em> باکتری <em>مزوزیزوبیوم سیسری</em> با ژن مشابه در باکتری<em> مزوزیزوبیوم لوتی</em> با استفاده از پایگاه اطلاعاتی NCBI، شباهت 90% را نشان داد . این ژن در باکتری <em>مزوزیزوبیوم سیسری</em> تشابه زیادی با سایر ژن های <em>nifH</em> گزارش شده مربوط به سایر گونه های ریزوبیوم دارد.