مقایسه روش‌های مختلف استخراج RNA ژنومی از گیاه دارویی بومادران (Achillea millefolium)

Abstract

<strong>در مطالعات مولکولی، استخراج </strong><strong>RNA</strong><strong> یک مرحله بسیار مهم به ‌شمار می‌رود و نتایج کارهای بعدی مانند </strong><strong>Real-TIME PCR</strong><strong> و </strong><strong>RACE PCR</strong><strong> به کیفیت و کمیت </strong><strong>RNA</strong><strong> استخراج شده بستگی دارد. تعدادی روش استاندارد</strong><strong>استخراج </strong><strong>RNA</strong><strong> کل از بافت گیاه که برای گیاهان عادی مؤثر هستند، در دسترس می‌باشد، اما استخراج </strong><strong>RNA</strong><strong> کل در گیاهان با سطوح بالای کربوهیدرات و متابولیت‌های ثانویه مانند ترکیبات فنولی مشکل می‌باشد. بومادران از گیاهان دارویی و صنعتی ارزشمند در مراتع ایران است که حاوی سطوح بالایی ار متابولیت‌های ثانویه می‌باشد ولی تاکنون روش مناسبی جهت استخراج </strong><strong>RNA</strong><strong> کل از آن معرفی نگردیده است. این پژوهش با هدف شناسایی بهترین روش از بین سه روش استخراج </strong><strong>RNA</strong><strong> کل شامل استخراج با بافر </strong><strong>(</strong><strong>-Plus</strong><strong>)</strong><strong>RNX^TM</strong><strong>، ‌لیتیم‌کلراید و فنل-کلروفورم از بافت‌های گل و برگ بومادران انجام گردید. نتایج نشان داد که از بین سه روش، </strong><strong>RNA</strong><strong> استخراج شده با روش فنل-کلروفورم دارای کمیت و کیفیت بالایی (با طول موج 280/260) در محدوده قابل قبول 2-8/1 می‌باشد. این موضوع به دلیل حذف پلی‌ساکاریدها و متابولیت‌های ثانویه به‌ویژه پلی‌فنل‌ها از محتویات سلولی بافت گیاه موجب استخراج بهتر </strong><strong>RNA</strong><strong> می‌گردد. به ‌همین دلیل این روش جهت استخراج </strong><strong>RNA</strong><strong> از این گیاه ارزشمند در مطالعات بعدی پیشنهاد می‌گردد.</strong>