طبقه‌بندی مولکولی و تجزیه و تحلیل شجره‌ای ژنوتایپ‌های 8-LPS1 جدایه‌های پاستورلا مولتوسیدای طیوری در ایران با استفاده از روش LPS- PCR typing

Abstract

پاستورلا مولتوسیدا یک پاتوژن گرم منفی و مهم در دامپزشکی می‌باشدکه براساس آنتی‌ژن پلی ساکاریدی به 16 سروتایپ با استفاده از روش ژل دیفیوژن تقسیم می‌شود. در این مطالعه روشLPS PCR typing برای تایپینگ مولکولی وآنالیز فیلوژنیک ژنوتایپ‌های 8 - LPS1 جدایه‌های پاستورلا مولتوسیدا از طیور ایران به کار گرفته شد. در این مطالعه 30 جدایه طیوری پاستورلا مولتوسیدا در محیط کشت اختصاصی (BHI) کشت داده شده و DNA ژنومی آن‌ها به روش جوشاندن استخراج گردید. شناسایی به روش بیوشیمیایی و مولکولی انجام گردید. ژنوتایپینگ لیپوپلی ساکاریدی به روش LPS-PCR و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی انجام شد. محصولات PCR از هر یک از ژنوتایپ‌ها تعیین سکانس شده و ارتباط آن‌ها با توالی‌های موجود در Gen bank مقایسه گردید. تمام ایزوله‌های مورد بررسی با روش LPS -PCR قابل تیپ‌بندی بودند. از بین جدایه‌ها، 18جدایه دارای ژنوتیپ L1 (60 درصد) و4جدایه دارای ژنوتیپ L2 (33/13 درصد) و 5 جدایه دارای ژنوتیپ L3 (66/16 درصد) و2جدایه دارای هرسه ژنوتیپ L1,L2,L3 (66/6 درصد) و 1جدایه دارای دو ژنوتیپ L2,L3 (33/3 درصد) بودند. هیچکدام ایزوله‌ای با ژنوتیپ‌های دیگر شناسایی نشدند ژنوتیپ‌های L4-L8 در بین جدایه‌های مطالعه شده شناسایی نشدند. در مقایسه نتایج توالی نوکلئوتیدی جدایه‌های بومی ایران با جدایه‌های موجود در Genbank اختلافات قابل توجه وجود داشت.روش LPS PCR typing نشان داد که سه ژنوتیپ L1, L2 و L3 پاستورلا مولتوسیدا در جدایه‌های بومی ایران حضور دارند. این تحقیق نشان داد که روش LPS- PCR یک سیستم تایپینگ مناسب برای افتراق بین جدایه‌های پاستورلا مولتوسیدا می‌باشد.