تجزیه تحلیل فیلوژنتیک ژن ND6 ژنوم میتوکندری در مرغ بومی سیستان و بلوچستان

Abstract

امروزه ژن‌های موجود در ژنوم میتوکندریایی به عنوان نشانگر ژنتیکی قوی به صورت گسترده کاربرد دارند. هدف از این مطالعه، توالی‌یابی ناحیه ND6 ژنوم میتوکندری مرغ خزک و بررسی رابطه فیلوژنتیکی این ناحیه از مرغ بومی خزک با دیگر نژاد‌های مرغ و برخی از ماکیان بود. برای این منظور نمونه خون از ورید بال 20 قطعه مرغ خزک از پژوهشکده دام‌های خاص استان سیستان و بلوچستان جمع‌آوری شد. استخراج DNA از خون کامل انجام گرفت. سپس ژن ND6 به همراه بخشی از tRNA بالادست و پایین دست (854 جفت باز) توسط آغازگرهای اختصاصی در واکنش زنجیره‌ای پلیمراز تکثیر شد. نمونه‌ها پس از خالص‌سازی توالی‌یابی شدند و تنوع ژنتیکی درون جمعیتی مورد بررسی قرار گرفت. در ادمه، پس از گرفتن 19 توالی مشابه ژنوم میتوکندریایی مربوط به سایر نژادهای مرغ و برخی از ماکیان از بانک جهانی ژن، تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک انجام گرفت. نتایج بدست آمده نشان داد که هیچ تفاوت نوکلئوتیدی بین توالی‌های نوکلئوتیدی ND6 مرغ‌های بومی خزک وجود نداشت. نتایج حاصل از رسم درخت فیلوژنتیک مرغ بومی خزک با دیگر نژادها نشان داد که بیشترین تشابه ژنتیکی این ناحیه از ژنوم میتوکندری مرغ خزک با نژاد مرغ‌های هوانگ لانگ، ژوسیانگ، فیجی، فلیپین، هانگشان زرد، جینو ووفنگ، مرغ جنگلی قرمز و مرغ اهلی مشاهده می‌شود. نتایج نشان دهنده قرابت ژنتیکی زیاد بین مرغ بومی خزک با مرغ‌های ژاپن و چین (جنوب شرقی آسیا) می‌باشد. کمترین تشابه ژنتیکی این ناحیه از مرغ بومی خزک با پرنده ماهی خوار تاج قرمز مشاهده شد.