گروه‌بندی فیلوژنتیکی برخی جدایه‌های نوکلئوپلی‌هیدروویروس کرم غنچه‌ی توتون (HaNPV) شمال ایران با استفاده از نشانگر RAPD

Abstract

به‌منظور غربال و بررسی تنوع ژنتیکی جدایه­های نوکلئوپلی­هدروویروس جمع‌آوری شده از کرم غنچه توتون از برخی مزارع توتون استان‌های مازندران و گلستان، از بین 10 آغازگر RAPD ده جفت بازی ساخت شرکت Operon به‌طور تصادفی ، دو جفت آغازگر OPM-03 و OPM-16 که بیشترین چندشکلی را در بین جدایه‌ها نشان دادند، انتخاب شدند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار PyElph و به‌روش UPGMA انجام و درخت فیلوژنی و جدول فواصل ژنتیکی رسم شد. تجزیه‌ی خوشه‌ای داده‌های مولکولی توانست جدایه‌ها را در فاصله‌ی ژنتیکی 20 به‌پنج گروه مجزا تقسیم بندی کند و می‌تواند در غربال جدایه‌های نوکلئوپلی هدروویروس به‌عنوان عامل کنترل بیولوژیک در کنترل کرم غنچه‌ی توتون، کرم قوزه‌ی پنبه، کرم میوه‌خوار گوجه‌فرنگی نقش ایفا نماید.