شناسائی ژن عامل رونویسی متصل شونده به عناصر پاسخ دهنده به کم‌آبی (DREB2) در علف هرز بروموس‌ ژاپنی (Bromus japonicus) تحت شرایط تنش شوری

Abstract

<strong>گونه‌های گیاهی مهاجم که به عنوان علف هرز شناخته می شوند گیاهان مقاوم به شرایط نامساعد محیطی هستند که از این ویژگی می‌توان در جهت دستکاری‌های ژنتیکی و تراریختی جهت مقاوم کردن گیاهان زراعی استفاده نمود. این تحقیق با هدف شناسائی ژن درگیر در تحمل گیاهان به تنش‌های غیرزنده و محیطی با نام </strong><strong>DREB2</strong><strong> در علف هرز بروموس ژاپنی اجرا گردید. بدین منظور ابتدا تنش شوری به گیاه بروموس ژاپنی با بکارگیری نمک کلرید سدیم اعمال گردید و پس از آن با توالی‌یابی و شناسائی ژن موثر در عمل مقاومت به تنش در این گیاه، توالی بدست آمده مورد بررسی قرار گرفت. تحلیل و مقایسه توالی بدست آمده با توالی این ژن در گیاهان دیگر با نرم افزارهای مختلف ار قبیل </strong><strong>BLAST</strong><strong>، </strong><strong>ExPasy</strong><strong>، </strong><strong>ELM</strong><strong>، </strong><strong>ClustalW</strong><strong> و </strong><strong>Meg</strong><strong>Align</strong><strong> صورت گرفت. نتایج موید این مطلب بود که قطعه تکثیر شده، مربوط به بخشی از ژن سنتز کننده فاکتور رونویسی متصل شونده به عناصر پاسخ دهنده تحت تنش شوری در این گیاه می‌باشد. مقایسه توالی ژن </strong><strong>DREB2</strong><strong> گیاه بروموس ژاپنی با سایر توالی‌های این ژن در گونه‌های گیاهی دیگر، ثابت کرد که </strong><strong><em>Bromus japonicus</em></strong><strong> و </strong><strong><em>Aegilops tauschii</em></strong><strong> با 9/89 درصد بیشترین شباهت (کمترین فاصله ژنتیکی) را دارد. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی اسیدآمینه حاصل از ترجمه توالی نوکلئوتیدی ژن </strong><strong>DREB2</strong><strong> در این گیاه از طریق نرم‌افزار </strong><strong>CDD</strong><strong>search</strong><strong> نشان داد که در این توالی، ناحیه </strong><strong>Domain</strong><strong>AP2</strong><strong> وجود دارد. این توالی با شماره دسترسی </strong><strong>KP406596</strong><strong> در بانک جهانی ژن </strong><strong>(NCI)</strong><strong> به ثبت رسید.</strong>