توپولوژی ساختار دامین اتصال مولیبدوپترین در گزانتین اکسیداز انسانی

Abstract

سابقه و هدف: دامین­ها اساس واحدهای عملکردی پروتئین­ها هستند. اطلاعات برهم­کنش دامین-دامین برای فهم حزئیات بر هم­کنش­های پروتئین - پروتئین، عملکرد سلول و فرآیندهای بیولوژیکی مطلوب است. آنزیم­های مولیبدوپترین در محدوده وسیعی از سیستم­های حیاتی در دهه­های مختلف شناسایی شده­اند. این آنزیم­ها نه تنها تسهیم­کننده مشترک دورنمای ساختاری، بلکه آشکار کننده توپولوژی­های تاخوردگی پلی­پپتیدهای متفاوت می­باشند. مواد و روش­ها: بر اساس توالی­های مترادف، 6 خانواده از آنزیم­ها مشمول کوفاکتور مولیبدنیم مشخص شده است. دامین­های ساختاری متمرکز شده، شاخص روشنی را برای ارتباطات ساختاری فراهم می­کنند که ناشی از نتایج درختچه­های فیلوژنی به­عنوان انعکاسی از عملکرد می­باشد. اغلب این فرآیند از مقایسه پروفایل­های توالی پروتئین یا مدل­های مخفی مارکوف حاصل می ­ شود. توانایی روش­های پیش­گویی را با استفاده از محل­های برهم­کنش به­عنوان تداخل­های هدف نشان می­دهیم. نتایج: امکان پیش­گویی محل­های برهم­کنش دامین با صحت و درستی زیاد با استفاده از اطلاعات توالی است. نتیجه­گیری: این الگوریتم­ها و آنالیزهای ارائه شده، پیشرفت شاخصی از توانایی مدل را برای تعیین دامین اتصال مولیبدوپترین و درک بیشتری از ارتباط بین تکامل توالی متمرکز شده و خواص ساختمان – عمل پروتئین ­ها فراهم می­کند.