شناسایی مولکولی و فیلوژنی گونه Gammarus komareki (Gammaridae) از رودخانه جاجرود با روش بارکدگذاری DNA

Abstract

گاماروس‌‌ها از انواع سخت‌‌پوستان ناجورپا متعلق به خانواده Gammaridae بوده که نقش و اهمیت زیادی در زنجیره غذائی، پالایش محیط از مواد آلی و حساسیت بالایی نسبت به آلودگی‌های محیطی دارند. بنابراین، شناسایی آنها از اهمیت زیادی برخوردار است. از آنجایی‌‌که شناسایی جنس گاماروس به‌‌ دلیل ویژگی‌‌های ریخت‌‌شناسی شبیه به هم بسیار مشکل می‌‌باشد، هدف مطالعه حاضر شناسایی دقیق مولکولی و بررسی روابط فیلوژنی گونه komareki Gammarusاز رودخانه جاجرود در شرق استان تهران در مقایسه با سایر نقاط ایران و جهان بود. بدین منظور، جمع‌‌آوری و نمونه‌‌برداری با استفاده از تور دستی کوچک از گونه G. komareki رودخانه جاجرود به صورت فصلی از مهر 1392 لغایت تیر 1393 صورت پذیرفت. به منظور مطالعات مولکولی مقداری بافت از هر نمونه با اسکالپل جدا و در الکل اتیلیک 95 درجه تثبیت گردید. سپس DNA نمونه‌‌ها با استفاده از روش CTAB استخراج و قطعه ژنی زیر واحد یک سیتوکروم اکسیداز میتوکندری (COI) تکثیر و توالی‌‌یابی شد. پس از تکثیر قطعه ژن و توالی‌‌یابی آن، درخت‌‌های تبارشناسی Neighbor Joining وMaximum Likelihood با استفاده از نرم‌‌افزارهای MEGA7 ترسیم گردیدند. نتایج مطالعه حاضر نشان داد، اگرچه نمونه‌‌های موردنظر از نظر ریخت‌‌شناسی متعلق به گونه komareki Gammarus می‌‌باشند که از سایر مناطق ایران گزارش شده است، با این‌‌حال بررسی‌‌های مولکولی نشان داد نمونه‌‌های مطالعه حاضر با قرار گرفتن در دو کلاد مختلف به دو دسته تقسیم شدند. بنابراین، این احتمال وجود دارد که شاید این نمونه‌‌ها متعلق به گونه‌‌های جداگانه ‌‌باشند. که اثبات این امر نیازمند بررسی‌‌های دقیق‌‌تر با سایر نشانگرهای ژنتیکی می‌‌باشد.