تعیین اپی توپ های ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونولوژی محاسبه ای

Abstract

زمینه و هدف: ایمونوگلوبولین‌ها(Igs) گروهی از پروتئین‌های سرم هستند که نقش مهمی در دفاع علیه میکروارگانیسم ها بر عهده دارند. ایمونوگلوبولین‌ها از زنجیره‌های سبک و سنگین تشکیل شده‌اند. زنجیره‌های سبک بر اساس تفاوت در انتهای کربوکسیلی ناحیه ثابت خود به دو ایزوتیپ کاپا (κ) و لامبدا (λ) تقسیم می‌‌شوند. تغییرات قابل توجهی در نسبت زنجیره‌های کاپا به لامبدا می‌تواند در گسترش منوکلونال لنفوسیت‌های B در بدخیمی سلول‌های B یا در عفونت با ویروس ایدز در دوران جنینی روی دهد. به منظور سنجش دقیق یا هدف گیری اختصاصی زنجیره‌های سبک برای اهداف درمانی، ابزارهایی شناسایی اختصاصی دارای حساسیت و ویژگی بالا از جمله آنتی بادی‌های منوکلونال مورد نیاز هستند. در این راستا تعیین دقیق اپی‌‌توپ‌های اختصاصی زنجیره‌های سبک حائز اهمیت خاصی است. ایمونولوژی محاسبه‌ای شاخه‌ای از علم ایمونولوژی است که با به کارگیری اطلاعات زیستی موجود در کامپیوتر به تشخیص دقیق‌تر بیماری‌ها کمک می‌کند. هدف مطالعه حاضر بررسی و تعیین اپی‌توپ‌های ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونولوژی محاسبه‌ای می‌باشد. روش کار: توالی اسیدهای امینه و ساختار سوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولین G مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی PDB (Protein Data Bank)، ساختار دوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولین توسط نرم افزار Phyre2 (Protein Homology/analogy Recognition Engine V 2.0) و اپی‌توپ‌های ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین G مرجع انسان توسط نرم افزار CEP تعیین شدند. یافته‌ها: در این مطالعه 5 اپی توپ ناپیوسته در دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین G انسان توسط نرم افزار CEP شناسایی شد. اپی‌توپ‌های فوق‌الذکر درناحیه قرارگیری اسیدهای آمینه شماره 100 الی 214 واقع شده‌اند. نتیجه‌گیری: در این پژوهش تعدادی از اپی‌توپ‌های ناپیوسته دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین G انسان شناسایی شدند. این اپی‌توپ‌ها ابزارهای بسیار ارزشمندی جهت تولید آنتی‌بادی‌های مونوکلونال اختصاصی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان بوده و می‌توانند به طور بالقوه برای تولید کیت‌های تشخیص اختصاصی زنجیره سبک، درمان برخی از بدخیمی‌های لنفوسیت B، تعیین نقشه اپی‌توپ‌های زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان و مطالعات تکاملی مفید باشند.