مدلسازی جزء آلفای پروتئین G انسانی و نتایج آن در مطالعه تداخل این پروتئین با گیرنده های غشایی

Abstract

انتقال پیامهای خارج سلولی از طریق گیرنده های وابسته به غشاء به آنزیمهای داخل سلول، نیازمند جفت شدن این برروی جزء آلفای این پروتئینها در GTP و GDP می باشد. این امر به کمک جابجایی G گیرنده ها با پروتئینهای حضور یون منیزیم امکان پذیر می گردد. چنین به نظر میرسد که الگوی ساختمانی تعدادی از اعضاء این خانواده به بدست آمده است ولی متاسفانه ساختمان پروتئینهای X به کمک کریستالوگرافی با اشعه EF-tu و ras-p21 عنوان مثال که به گیرنده ای غشایی متصل می شوند هنوز در دست نیست. لذا روشهای مدلسازی ملکوتی به کمک کامپیوتر در G انسانی ) بر اساس Gs مقاله حاضر مورد استفاده قرار گرفته است تا ساختمان یکی از این پروتئینها ( جزء آلفای پروتئین باکتریایی مدلسازی گردد. EF-tu ساختمان پروتئین تشابه بالایی را نشان می دهد و Gs با پروتئین EF-tu نتایج بدست آمده نشان می دهد که توالی اسید آمینه های این قسمت از زنجیره اسید آمینه ها تشکیل یک هسته اصلی را میدهد که می توان به آن لوپهای سطحی اضافه نمود تا را مدلسازی کرد. Gs بتوان ساختمان پروتئین هیدروفوب بوده و احتمالا GDP درمجاورت اتصال Gs ساختمان نهایی بدست آمده نشان می دهد که سطح ملکول ترمینال در مجاورت یکدیگر و در فضای -C ترمینال و N- این قسمت به غشاء سلول متصل می باشد. بخشهای انتهایی داخل سلولی قرار دارد. مدل بدست آمده با اطلاعات بدست آمده از مطالعات بیوشیمیایی همخوانی بالایی داشته و می تواند در مطالعه نحوه اتصال این ملکول با گیرنده های مختلف غشایی مورد استفاده قرار گیرد.