شناسایی ژن نورامینیداز ویروس آنفلونزای پرندگان (H9N2) جدا شده از شیوع اخیر بیماری در ایران

Abstract

سابقه و هدف: ویروس آنفلونزا باعث بروز بیماری‌های با پاتوژنیسیته متفاوت در میزبان‌ها می‌شود. ویروس‌های آنفلونزای A بر اساس گلیکوپروتئین‌های نورامینیداز و هماگلوتینین به تحت تیپ‌های مختلفی تقسیم می‌شوند. ویروس آنفلونزای پرندگان به طور معمول باعث بیماری در انسان نمی‌شود اما عفونت‌های اسپورادیک آن در انسان گزارش شده است. هدف این مطالعه، شناسایی و تعیین توالی ژن نورامینیداز ویروس آنفلونزای H9N2 جدا شده از اپیدمی اخیر بیماری در ایران، و مقایسه این ایزوله‌ها با سویه‌های سایر کشورها بود. مواد و روش ‌ ها: ایزوله‌های ویروسی بر روی تخم‌مرغ‌های جنین‌دار پاساژ داده شد و RNA آن‌ها توسط کیت تجاری RNX استخراج گردید. تکثیر ژن نورامینیداز با روش RT-PCR انجام شد. محصول پس از الکتروفورز و خالص‌سازی، سکانس گردید. یافته ‌ ها: توالی‌های نوکلئوتیدی ژن نورامینیداز شش سویه ویروس آنفلونزای H9N2 جدا شده از نواحی مختلف ایران شناسایی و در پایگاه داده GeneBank به ثبت رسید. آنالیز مقایسه‌ای این توالی‌ها با توالی نمونه‌های رفرانس انجام شد. هیچ نوع جهشی در ناحیه سیتوپلاسمی مشاهده نشد، اما چهار جهش در بخش عبوری از غشا اتفاق افتاده است. که دو جهش آن از نوع خاموش بوده و دو جهش دیگر به جایگزینی اسیدآمینه آب‌گریز با اسید آمینه آب‌گریز دیگر منجر شده است. نتیجه ‌ گیری: آنالیز توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی ژن نورامینیداز ویروس آنفلونزای H9N2 حاصل از ایزوله‌های ایران، دارای شباهت زیادی به سویه‌های گزارش شده از کشورهای همسایه همانند پاکستان و عربستان بودند. به‌نظر می‌رسد آن‌ها دارای منشاء و تبار یکسان هستند.