جذب سطحی وانکومایسین روی ریزتیر با کاربرد زیست‌حسگری بر پایه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

Abstract

p b= dir=rtl style=margin: 0px 0px 10px; text-align: justify; font-stretch: normal; font-size: 9px; line-height: normal; font-family: span style=font-size:12px;span style=font-family:iransharp;فرآیند شبیه‌سازی جذب آنتی‌بیوتیک وانکومایسین توسط روش دینامیک مولکولی در این مقاله مورد بررسی قرار گرفته است. این فرآیند به تعیین رفتار جذب وانکومایسین به سطح فعال‌سازی‌شده یک حسگر زیستی منجر شده است. با توجه به اهمیت کاربرد آنتی‌بیوتیک‌ها در فرآیند درمانی آلودگی‌های میکروبی، در این مقاله، بررسی سازوکار مولکولی وانکومایسین با نگاه شبیه‌سازی چند مقیاسی به انجام رسیده است. با توجه به سازوکار عملکرد وانکومایسین، چگونگی اتصال یا جذب آن به یک چیدمان تک‌لایه مولکولی مد نظر قرار گرفته است. فرآیند جذب روی سطح یک حسگر زیستی شبیه‌سازی شده است. حسگر زیستی مورد نظر از نوع ریزتیر یکسرگیردار بوده که با تکمیل فرآیند جذب، با توجه به تغییر کشش سطحی تغییر شکل پیدا می‌کند. این تغییر شکل توسط روش‌های محاسباتی چند مقیاسی برای حالات تجربی متناظر به دست آمده است. برای بررسی دقیق متغییرهای این مساله، مدل‌های دینامیک مولکولی برای سطح حسگر حین جذب زیستی در حالات خلأ و محیط آبی حل شده است. چگونگی بررسی فرآیند جذب در غالب بررسی مقدار پارامتر انرژی متناظر با کشش سطحی با تغییرات فاصله مولکول هدف و سطح جذب بوده است. همچنین در تعیین فواصل چیدمان مولکولی لایه فعال سطح جاذب روی حسگر، الگوریتمی برای انتخاب چیدمان با توجه به کارهای تجربی مورد توجه قرار گرفته است. مقادیر کشش سطحی به‌دست‌آمده در محدوده کارهای تجربی به دست آمده استspan dir=LTR./span/span/spanbr nbsp;/p