بررسی میزان بیان ژن ELTD1 در سلول‌های سرطانی HT29 تیمار شده با ملاتونین: مطالعه بیوانفورماتیکی و تجربی

Abstract

پیش‌زمینه و هدف: سرطان کلورکتال بعد از سرطان­های ریه و پستان بیشترین میزان مرگ‌ومیر را در بین سرطان‌ها دارد. ژن ELTD1 کد کننده‌ی یک پروتئین متصل شونده به G-protein می‌باشد که به‌عنوان گیرنده فاکتور رشد عمل می‌کند و در رگزایی طبیعی و همچنین سرطانی شدن سلول‌ها نقش دارد. ازآنجایی‌که اثرات مثبت ملاتونین بر افزایش مرگ‌ومیر سلول‌های سرطانی و کاهش متاستاز و رگزایی ثابت شده است، بنابراین هدف از مطالعه حاضر ارزیابی میزان بیان ژن ELTD1 در سلول‌های سرطانی HT29 تیمار شده با ملاتونین به دو روش بیوانفورماتیکی و تجربی می­باشد. مواد و روش‌ کار: ابتدا داده­های میکروآرایه از پایگاه داده GEO تهیه شد و با استفاده از جعبه‌ابزار شبکه عصبی (PNN ) در نرم‌افزار MATLAB 2018a آنالیز شد. سمیت سلولی ملاتونین به روش تست MTT ارزیابی شد. درنهایت Q-RT-PCR برای ارزیابی میزان بیان ژن ELTD1 در سلول‌های HT29 تیمار شده با ملاتونین استفاده شد. یافته‌ها: نتایج مربوط به آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد که میزان بیان ژن ELDT1 در سلول‌های تیمار شده با ملاتونین در مقایسه با گروه کنترل به‌صورت قابل‌توجهی کاهش یافت. بررسی سمیت سلولی به روش تست MTT نشان داد که ملاتونین زیستایی سلول‌های HT29 را به‌صورت وابسته به غلظت دارو و زمان کاهش داد و غلظت IC50 (مهار 50درصد از رشد سلولی) در 48 ساعت برابر µM 160 محاسبه شد. به‌علاوه آنالیز مربوط به نتایج Q-RT-PCR نشان داد که ملاتونین میزان بیان ژن ELTD1 را به‌صورت معنی­داری (P≤ 0.05 ) کاهش داد که هم سو با نتایج به‌دست‌آمده از آنالیز بیوانفورماتیکی می­باشد. بحث و نتیجه‌گیری: نتایج به‌دست‌آمده نشان می­دهد که ژن ELTD1 می­تواند به‌عنوان ژن هدف ملاتونین در درمان سرطان کلورکتال مورداستفاده قرار گیرد. اگرچه برای تأیید یافته­های مطالعه حاضر نیاز به مطالعات بیشتری است.