کاربرد تکنیک مولکولی One-step-RT-LAMP در تشخیص ویروس SARS-CoV-2 در نمونه‌های نازوفارنکس جمع‌آوری شده از مراکز درمانی و رفرانس استان تهران

Abstract

مقدمه: تشخیص مولکولی سریع، دقیق و اختصاصی ویروس SARS-CoV-2 در راستای پیشگیری و مبارزه با بیماری کرونا بسیار حائز اهمیت می‌باشد؛ لذا هدف از این تحقیق بررسی ارزش تشخیصی تکنیک مولکولیLAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification) در ارزیابی سریع، کسب نتایج دقیق و کاهش هزینه‌های آزمایش کرونا در مقایسه با دیگر روش‌های مولکولی روتین می‌باشد. مواد و روش ها: طی این مطالعه مقطعی توصیفی تحلیلی 342 نمونه نازوفارنکس از مراکز درمانی رفرانس شهر تهران جمع‌آوری شد. در مرحله بعد، استخراج RNA از نمونه‌ها انجام شد. پس از طراحی پرایمر برای ژن N، سنجش RT-LAMP انجام شد. برای تایید نتایج، محصولات LAMP، بر روی ژل آگارز الکتروفورز شدند. همچنین از نظر حساسیت و ویژگی، تکنیک RT-LAMP مورد ارزیابی قرار گرفت. جهت تجزیه و تحلیل آماری نتایج از نرم‌افزار SPSS نسخه 22 و آزمون‌های آماری مجذور کای، توافق کاپا و دقیق فیشر استفاده شد. یافته ­ها: نتایج نشان داد که ارتباط معناداری بین جنسیت و شدت بیماری وجود دارد (001/0>(P، حال آنکه ارتباط معناداری از نظر متغیر سن وجود نداشت (05/0>(P. از نظر علائم بالینی ارتباط معناداری بین شدت عفونت ویروس با علائم تب، سرفه و سردرد وجود داشت (001/0>(P. همچنین از نظر آماری ارتباط معناداری بین بیماری دیابت و شدت بیماری مشاهده شد (001/0> .(Pاز نظر حساسیت و ویژگی تکنیک RT-LAMP، میزان حساسیت در این تکنیک رقت 101×1 و ویژگی 100٪ بدست آمد. بحث و نتیجه ­گیری: تشخیص سریع و به موقع ویروس کرونا بدلیل سرعت سرایت بالای ویروس بسیار حیاتی می‌باشد. لذا نیاز به روش تشخیصی سریع و ارزان و قابل انجام در مکان‌های مختلف و مقرون به صرفه با حساسیت و ویژگی بالا احساس می‌گردد. بر اساس نتایج بدست آمده از مطالعه حاضر تکنیک RT- LAMP روشی سریع، حساس و مؤثر در تشخیص SARS-CoV-2 می‌باشد.